20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2191 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 111 aa  225  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  80.18 
 
 		 111 aa  184  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  34.78 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  39.71 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  32 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  37.21 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  28.57 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.94 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  26.32 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  31.71 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 		 116 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  28.75 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  32.95 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  51.22 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>