More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2180 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 477 aa  929    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  89.94 
 
 		 477 aa  803    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.42 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.25 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.35 
 
 		 483 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.43 
 
 		 475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.31 
 
 		 474 aa  323  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.25 
 
 		 500 aa  296  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 493 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 475 aa  289  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.63 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 465 aa  276  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 482 aa  273  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.06 
 
 		 478 aa  266  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.35 
 
 		 482 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 477 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.89 
 
 		 462 aa  261  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 522 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  35.93 
 
 		 492 aa  253  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 416 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.85 
 
 		 514 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 		 486 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.38 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  34.23 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 467 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 		 496 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 		 579 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 455 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 476 aa  233  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  33.76 
 
 		 465 aa  233  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 455 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  35.35 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 460 aa  229  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.14 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.14 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 476 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.64 
 
 		 528 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.83 
 
 		 471 aa  226  9e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.61 
 
 		 529 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 		 478 aa  223  6e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  36.19 
 
 		 473 aa  223  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.94 
 
 		 474 aa  223  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.41 
 
 		 522 aa  222  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.61 
 
 		 529 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 529 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  33.77 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 445 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 		 540 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  36.01 
 
 		 510 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 		 497 aa  217  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  32.78 
 
 		 474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  34.49 
 
 		 467 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 457 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 		 504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  34.07 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 		 511 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  33.66 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.97 
 
 		 646 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  34.07 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  33.66 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.97 
 
 		 646 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.97 
 
 		 646 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  33.41 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  33.41 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.98 
 
 		 495 aa  211  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>