More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2150 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  88.05 
 
 
385 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
397 aa  793    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  63.08 
 
 
382 aa  481  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  46.32 
 
 
393 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  39.51 
 
 
400 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  41.62 
 
 
366 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 
370 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  39.43 
 
 
370 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  37.44 
 
 
408 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
371 aa  213  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  39.86 
 
 
417 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
374 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  37.09 
 
 
351 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
366 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
435 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  31.45 
 
 
375 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  37.68 
 
 
395 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 
373 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  30.91 
 
 
375 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
374 aa  189  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
375 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 
384 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
381 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
370 aa  186  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 
374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  35.52 
 
 
381 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  40.92 
 
 
380 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
378 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 
398 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  38.11 
 
 
380 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
377 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  41.45 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
380 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  39.78 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  39.68 
 
 
346 aa  172  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
346 aa  172  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
394 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 
395 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
387 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
387 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
366 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
372 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  38.63 
 
 
384 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  28.95 
 
 
381 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  38.17 
 
 
376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  28.65 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
367 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  36.95 
 
 
535 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
398 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
376 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
381 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
381 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
380 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 
383 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  38.11 
 
 
340 aa  160  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.54 
 
 
361 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  37.54 
 
 
361 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
376 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  34.35 
 
 
373 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
376 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.54 
 
 
401 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.54 
 
 
414 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.54 
 
 
414 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.54 
 
 
414 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.54 
 
 
414 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  33.7 
 
 
430 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
444 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
394 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
382 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
380 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 
428 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.7 
 
 
361 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.27 
 
 
364 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.9 
 
 
369 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  36.88 
 
 
1261 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  33.92 
 
 
375 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  38.41 
 
 
524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
371 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 
360 aa  153  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
376 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  36.98 
 
 
394 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
371 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.23 
 
 
336 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
381 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  38.56 
 
 
423 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  33.42 
 
 
375 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
386 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>