259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2147 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2147  FHA domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3525  FHA domain-containing protein  72.26 
 
 
139 aa  205  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.995835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  34.29 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  37.39 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  37.07 
 
 
179 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.64 
 
 
863 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 
310 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0032  FHA domain containing protein  38.71 
 
 
235 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.87 
 
 
899 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.87 
 
 
903 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2339  FHA domain containing protein  38 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  40 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  33.67 
 
 
219 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  41.67 
 
 
234 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  40.21 
 
 
474 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13850  FHA domain-containing protein  42.17 
 
 
141 aa  58.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  49.25 
 
 
851 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2044  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
405 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130358  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4010  FHA domain containing protein  38.38 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.196899  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2713  forkhead-associated protein  40.43 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0116  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  40.28 
 
 
219 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0031  FHA domain containing protein  38.64 
 
 
235 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  37.35 
 
 
252 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2822  FHA domain-containing protein  39.39 
 
 
247 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000875758  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3096  FHA domain containing protein  37.62 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  normal  0.0108449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  34.17 
 
 
1424 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  37.97 
 
 
518 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  36.36 
 
 
617 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15520  FHA domain-containing protein  35.42 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  39.24 
 
 
515 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00240  FHA domain-containing protein  38.55 
 
 
239 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0176  FHA domain containing protein  36.47 
 
 
238 aa  53.9  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.74043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1738  FHA domain containing protein  33.64 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  34.12 
 
 
618 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2775  Forkhead-associated protein  35.71 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  38.81 
 
 
238 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  36.45 
 
 
1057 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  37.11 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3436  FHA domain-containing protein  35.44 
 
 
244 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  37.14 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  37.14 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2102  FHA domain containing protein  37.8 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11857  hypothetical protein  37 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4997  FHA domain-containing protein  37.11 
 
 
221 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4783  FHA domain-containing protein  33.68 
 
 
236 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  35.71 
 
 
1053 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  38.64 
 
 
288 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
242 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0191  FHA domain-containing protein  32.26 
 
 
228 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  32.61 
 
 
518 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  40.45 
 
 
1167 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
241 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  34.69 
 
 
242 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
211 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
211 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  30.93 
 
 
694 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  36.99 
 
 
221 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  32.26 
 
 
225 aa  50.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18260  FHA domain-containing protein  35.42 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  38.57 
 
 
513 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  46.43 
 
 
1108 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
157 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1886  FHA domain containing protein  35.42 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0328071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
183 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  38.89 
 
 
233 aa  50.4  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2541  FHA domain-containing protein  40.68 
 
 
247 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00963691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  37.89 
 
 
170 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  34.74 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3863  FHA domain-containing protein  42.65 
 
 
503 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.312796  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  31.62 
 
 
1428 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0024  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
280 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3359  forkhead-associated  30.21 
 
 
234 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  39.77 
 
 
289 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  38.55 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  49.02 
 
 
895 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1775  hypothetical protein  33.73 
 
 
302 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00409515  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.27 
 
 
838 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  34.12 
 
 
1065 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26930  FHA domain-containing protein  35.05 
 
 
237 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.583878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
326 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
338 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5167  FHA domain containing protein  29.69 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.445837  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1302  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5356  FHA domain containing protein  34.74 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
326 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0036  FHA domain protein  38.89 
 
 
233 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  34.25 
 
 
220 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  40.85 
 
 
245 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3742  FHA domain-containing protein  36.46 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0024  FHA domain containing protein  37.65 
 
 
235 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  43.14 
 
 
851 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4189  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 
336 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0924354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1470  FHA domain containing protein  38.3 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  42.65 
 
 
866 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  42.65 
 
 
866 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>