52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2123 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  75.47 
 
 		 238 aa  333  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  50.79 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  41.5 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  43.75 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  46.59 
 
 		 268 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  44 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  35.2 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  38.38 
 
 		 871 aa  141  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  38.83 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  32.28 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  32.47 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  36.27 
 
 		 240 aa  124  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  33.85 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  29.59 
 
 		 509 aa  117  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  48.82 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  29.9 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  33.14 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  25.76 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  29.56 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  28.29 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  30.56 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  28.25 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.21 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  21.99 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  22.93 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  27.08 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  32.46 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.32 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  27.6 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  60.98 
 
 		 48 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  32.37 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  23.83 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  24.85 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  25.59 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  22.8 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  27.97 
 
 		 372 aa  45.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0641  hypothetical protein  27.54 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.726256 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  25.32 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0711  lipolytic protein G-D-S-L family  27.78 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  21.72 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  22.34 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  23.35 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  27.61 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  26.06 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  22.5 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  24.06 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  20.41 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.73 
 
 		 261 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  20.77 
 
 		 221 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  26.12 
 
 		 348 aa  41.6  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  33.07 
 
 		 244 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>