26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2122 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  501  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  92.56 
 
 
242 aa  470  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  61.16 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  59.66 
 
 
242 aa  298  7e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  56.2 
 
 
241 aa  285  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  56.2 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  55.79 
 
 
242 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  48.76 
 
 
239 aa  234  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  46.69 
 
 
239 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  45.45 
 
 
239 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  47.52 
 
 
238 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  35.89 
 
 
243 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  36.59 
 
 
249 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  34 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  34.16 
 
 
237 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  34.98 
 
 
234 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  33.06 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  37.08 
 
 
248 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  33.19 
 
 
250 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  23.49 
 
 
267 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  27.38 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  29.3 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  23.31 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  28.05 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  28.91 
 
 
642 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  24.54 
 
 
272 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>