More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2118 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  616  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  86.41 
 
 
311 aa  544  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  58.47 
 
 
313 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  45.31 
 
 
307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  45.42 
 
 
306 aa  271  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  44.3 
 
 
313 aa  266  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  44.37 
 
 
302 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  42.16 
 
 
307 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  44.59 
 
 
313 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  43.28 
 
 
306 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  44.81 
 
 
313 aa  260  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  42.49 
 
 
312 aa  257  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  42.57 
 
 
307 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  42.57 
 
 
307 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  42.81 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  45.28 
 
 
306 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  46.13 
 
 
314 aa  248  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  46.6 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  41.18 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  50.84 
 
 
299 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.23 
 
 
321 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  39.8 
 
 
301 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  50 
 
 
302 aa  238  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  39.47 
 
 
301 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  44.52 
 
 
298 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  39.14 
 
 
301 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  39.47 
 
 
301 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  39.8 
 
 
301 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  39.47 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  39.47 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  39.47 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  40.2 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  44.77 
 
 
492 aa  235  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  41.5 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  46.53 
 
 
297 aa  232  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  42.12 
 
 
373 aa  231  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  42.35 
 
 
462 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  45.93 
 
 
308 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  38.82 
 
 
301 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  39.81 
 
 
303 aa  225  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  42.38 
 
 
298 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3645  domain of unknown function DUF1731  48.63 
 
 
298 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  41.72 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.4 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  44.44 
 
 
299 aa  219  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 
304 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  41.1 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  41.75 
 
 
300 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  41.58 
 
 
296 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  46.13 
 
 
307 aa  215  8e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.62 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  41.39 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  41.39 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  39.2 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  38.26 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  40.8 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  40.4 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  37.42 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  40.85 
 
 
298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  40.33 
 
 
300 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  39.4 
 
 
297 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  42.09 
 
 
304 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  39.4 
 
 
297 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  39.4 
 
 
297 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  39.4 
 
 
297 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  39.4 
 
 
297 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  40.2 
 
 
302 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  39.2 
 
 
295 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  38.94 
 
 
301 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  39.4 
 
 
297 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  39.73 
 
 
297 aa  209  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  39.73 
 
 
297 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  39.73 
 
 
297 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  39.73 
 
 
297 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  39.73 
 
 
297 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.28 
 
 
301 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.39 
 
 
297 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  44.44 
 
 
316 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.39 
 
 
297 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  38.74 
 
 
301 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  39.39 
 
 
297 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  41.69 
 
 
313 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  40.52 
 
 
298 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  37.95 
 
 
301 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  39.74 
 
 
296 aa  205  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  39.39 
 
 
297 aa  206  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  40.07 
 
 
304 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  39.87 
 
 
300 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3719  domain of unknown function DUF1731  49.32 
 
 
298 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.488792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.39 
 
 
299 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  39.67 
 
 
309 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  40.33 
 
 
298 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  36.48 
 
 
310 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  37.62 
 
 
309 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  44.59 
 
 
295 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  37.25 
 
 
300 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  37.42 
 
 
304 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.46 
 
 
297 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  40 
 
 
464 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3579  hypothetical protein  48.97 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.406698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>