More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2035 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  76.74 
 
 		 301 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  34.56 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  31.39 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  34.48 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  28.99 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 278 aa  92.4  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  31.53 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0559  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.67 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.199984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.19 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.57 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  30 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  25.55 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06151  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  26.25 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.117028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  29.86 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.57 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05851  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  26.42 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.597895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  27.5 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.99 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.65 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.85 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.92 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.95 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 198 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  27.8 
 
 		 200 aa  54.3  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  29.21 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  28.81 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  27.8 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  26.71 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  28.66 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 		 235 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.27 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  29.27 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  30.19 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.99 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.07 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  30.29 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 202 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  29.27 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  26.27 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  25.48 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.42 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.51 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  31.38 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  26.67 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  22.17 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1889  hydroxyacylglutathione hydrolase  22.22 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  27.87 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  31.21 
 
 		 224 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  30.63 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 218 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  27.36 
 
 		 224 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 		 425 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 214 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.05 
 
 		 222 aa  49.7  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>