More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2008 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 572 aa  1158    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  82.34 
 
 		 572 aa  959    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.6 
 
 		 570 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.69 
 
 		 573 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.83 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  42.48 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.06 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.03 
 
 		 885 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.71 
 
 		 573 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.96 
 
 		 586 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.58 
 
 		 568 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  41.74 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.91 
 
 		 578 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.91 
 
 		 907 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.79 
 
 		 584 aa  381  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.88 
 
 		 564 aa  379  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.02 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 584 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.83 
 
 		 801 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.2 
 
 		 599 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.04 
 
 		 788 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.93 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.64 
 
 		 811 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.34 
 
 		 779 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.79 
 
 		 779 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.78 
 
 		 573 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.79 
 
 		 779 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.3 
 
 		 564 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.56 
 
 		 827 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.96 
 
 		 573 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 779 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.42 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.77 
 
 		 773 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.27 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.06 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.25 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  36.47 
 
 		 566 aa  366  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.25 
 
 		 779 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.11 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  35.2 
 
 		 574 aa  368  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.92 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.07 
 
 		 779 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  34.5 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.07 
 
 		 779 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.05 
 
 		 785 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.88 
 
 		 779 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.21 
 
 		 568 aa  360  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.16 
 
 		 814 aa  359  7e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  38.83 
 
 		 932 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.72 
 
 		 587 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 570 aa  356  6.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.13 
 
 		 567 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.04 
 
 		 574 aa  352  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.6 
 
 		 831 aa  346  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  35.46 
 
 		 742 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.05 
 
 		 573 aa  343  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.26 
 
 		 578 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 798 aa  343  5e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  35.52 
 
 		 736 aa  343  5e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.93 
 
 		 732 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.51 
 
 		 568 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  35.13 
 
 		 592 aa  339  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.36 
 
 		 865 aa  332  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.51 
 
 		 883 aa  330  3e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.41 
 
 		 1102 aa  329  7e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 574 aa  329  9e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.77 
 
 		 571 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.16 
 
 		 757 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.1 
 
 		 583 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.55 
 
 		 576 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.98 
 
 		 989 aa  324  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.58 
 
 		 977 aa  323  5e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  35.56 
 
 		 684 aa  322  8e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.1 
 
 		 813 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.41 
 
 		 1134 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.25 
 
 		 654 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  34.34 
 
 		 655 aa  321  3e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.53 
 
 		 756 aa  319  7.999999999999999e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0876  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.69 
 
 		 592 aa  319  9e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0250964  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.04 
 
 		 757 aa  319  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.04 
 
 		 757 aa  319  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.8 
 
 		 1122 aa  319  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.4 
 
 		 857 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.01 
 
 		 571 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.83 
 
 		 864 aa  316  6e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 573 aa  316  7e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  35.61 
 
 		 571 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.49 
 
 		 911 aa  310  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 655 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 655 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.59 
 
 		 569 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.23 
 
 		 569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.41 
 
 		 569 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  33.28 
 
 		 701 aa  307  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.33 
 
 		 574 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  36.28 
 
 		 571 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.55 
 
 		 579 aa  306  9.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.53 
 
 		 569 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.54 
 
 		 573 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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