208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1998 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  58.05 
 
 		 606 aa  701    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  100 
 
 		 603 aa  1226    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  85.48 
 
 		 603 aa  1065    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  50.93 
 
 		 593 aa  634  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  47.47 
 
 		 584 aa  512  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  46.52 
 
 		 587 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  40.85 
 
 		 586 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.9 
 
 		 582 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  35.3 
 
 		 597 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.18 
 
 		 612 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  33.27 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  33.67 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  29.78 
 
 		 600 aa  259  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.44 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  30.49 
 
 		 598 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  31.45 
 
 		 603 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  30.54 
 
 		 599 aa  249  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  29.44 
 
 		 593 aa  243  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.77 
 
 		 603 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.74 
 
 		 588 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.76 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.5 
 
 		 592 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.96 
 
 		 588 aa  208  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  32.44 
 
 		 596 aa  206  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  31.51 
 
 		 612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.8 
 
 		 615 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.65 
 
 		 607 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.81 
 
 		 620 aa  198  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.33 
 
 		 578 aa  198  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.67 
 
 		 584 aa  194  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.88 
 
 		 634 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  27.68 
 
 		 573 aa  191  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.02 
 
 		 616 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.9 
 
 		 589 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.34 
 
 		 616 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.48 
 
 		 597 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.4 
 
 		 589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.48 
 
 		 616 aa  183  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2599  oligoendopeptidase F  29.54 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.22 
 
 		 623 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  28.48 
 
 		 664 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2360  peptidase, family M3  29.22 
 
 		 529 aa  181  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.995178  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  30.09 
 
 		 598 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  30.09 
 
 		 598 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  26.73 
 
 		 620 aa  180  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  26.23 
 
 		 573 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.95 
 
 		 617 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.41 
 
 		 601 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.94 
 
 		 617 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.74 
 
 		 622 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2672  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31 
 
 		 539 aa  178  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0535944  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  26.57 
 
 		 620 aa  178  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.29 
 
 		 614 aa  178  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2628  oligoendopeptidase F  28.97 
 
 		 527 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000191518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  27.21 
 
 		 619 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2874  peptidase, family M3  28.77 
 
 		 527 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.98 
 
 		 601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  25.82 
 
 		 573 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.19 
 
 		 625 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.81 
 
 		 573 aa  174  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  25.99 
 
 		 632 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.07 
 
 		 620 aa  174  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.3 
 
 		 590 aa  173  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.57 
 
 		 626 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  24.46 
 
 		 569 aa  173  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.73 
 
 		 608 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.2 
 
 		 625 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  26.55 
 
 		 571 aa  172  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2902  oligoendopeptidase F, putative  29.45 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000435555  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  26.01 
 
 		 572 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2885  peptidase, family M3  30.54 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  25.7 
 
 		 610 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  25.46 
 
 		 573 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.34 
 
 		 625 aa  170  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.49 
 
 		 638 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.09 
 
 		 607 aa  169  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.64 
 
 		 626 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2917  peptidase, family M3  29.17 
 
 		 527 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.496699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.34 
 
 		 620 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.83 
 
 		 627 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.69 
 
 		 606 aa  163  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.61 
 
 		 606 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.36 
 
 		 615 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  27.06 
 
 		 606 aa  161  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2676  peptidase  30.84 
 
 		 394 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000426358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.26 
 
 		 597 aa  160  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.25 
 
 		 606 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  28.95 
 
 		 599 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  26.9 
 
 		 611 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  25.42 
 
 		 601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4751  oligoendopeptidase F  28.92 
 
 		 605 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  25.17 
 
 		 596 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  25.77 
 
 		 566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  28.98 
 
 		 600 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  25.58 
 
 		 594 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  23.83 
 
 		 604 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  25.18 
 
 		 608 aa  130  6e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0805  group B oligopeptidase PepB  26.14 
 
 		 601 aa  130  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.036965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  23.57 
 
 		 595 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  27.29 
 
 		 577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>