299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1991 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1991  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3269  molybdopterin binding domain-containing protein  70.22 
 
 		 274 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  44.32 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0886  molybdopterin binding domain-containing protein  43.35 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000053068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  48.09 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  39.73 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  38.36 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  34.5 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  34.38 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  38.49 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  35.06 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  35 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  32.85 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  28.8 
 
 		 413 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  39.78 
 
 		 415 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  30.71 
 
 		 420 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 392 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  32.92 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  30 
 
 		 391 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  32.92 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  31.76 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  32.83 
 
 		 393 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  36.69 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  35.2 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  32.44 
 
 		 395 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  33.83 
 
 		 419 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  37.57 
 
 		 398 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  37.57 
 
 		 398 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  37.57 
 
 		 398 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  37.57 
 
 		 398 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  37.57 
 
 		 398 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  27.92 
 
 		 401 aa  105  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  36.9 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.92 
 
 		 401 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  31.7 
 
 		 411 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  32.22 
 
 		 415 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  35.36 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  32.28 
 
 		 425 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  35.36 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  35.36 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  35.36 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  35.36 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  35.36 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  30.41 
 
 		 417 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  34.81 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  35.36 
 
 		 400 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 		 418 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.84 
 
 		 429 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  26 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  34.81 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  32.24 
 
 		 415 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  32.55 
 
 		 424 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.26 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  30.82 
 
 		 414 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  31.6 
 
 		 424 aa  99.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.94 
 
 		 424 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.68 
 
 		 431 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  24.82 
 
 		 415 aa  99.4  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  28.23 
 
 		 423 aa  99  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  30.88 
 
 		 425 aa  99  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  35.36 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  35.36 
 
 		 397 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  31.48 
 
 		 415 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  35.29 
 
 		 423 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  32.02 
 
 		 416 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  31.03 
 
 		 424 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  30.33 
 
 		 424 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  34.81 
 
 		 397 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  30.81 
 
 		 424 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  29.02 
 
 		 411 aa  96.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  28.57 
 
 		 415 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  28.28 
 
 		 417 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  30.88 
 
 		 425 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  30.88 
 
 		 425 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1643  competence/damage-inducible protein CinA  29.23 
 
 		 393 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.77 
 
 		 424 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  33.18 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  31.03 
 
 		 416 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  28.04 
 
 		 408 aa  95.9  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  31.03 
 
 		 416 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  32.72 
 
 		 242 aa  95.9  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  33.7 
 
 		 397 aa  95.5  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  35.39 
 
 		 413 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 424 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  29.75 
 
 		 414 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  32.2 
 
 		 424 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  30.69 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 408 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  27.44 
 
 		 424 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  29.25 
 
 		 433 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.45 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 424 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  31.69 
 
 		 420 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  27.86 
 
 		 412 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  27.92 
 
 		 416 aa  94  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 424 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  34.81 
 
 		 397 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 424 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  34.25 
 
 		 397 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>