More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1983 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
469 aa  924    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  82.97 
 
 
463 aa  710    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  49.01 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
574 aa  179  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  43.1 
 
 
529 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 
610 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  39.13 
 
 
379 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  37.25 
 
 
391 aa  153  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  35.53 
 
 
391 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  38.24 
 
 
393 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
725 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  37.5 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  37.15 
 
 
489 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  35.58 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  41.97 
 
 
395 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  36.97 
 
 
347 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  35.29 
 
 
353 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
682 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  37.04 
 
 
357 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
584 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  36.45 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
665 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  34.67 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  36.74 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  35.55 
 
 
223 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  35.93 
 
 
643 aa  127  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  28.51 
 
 
596 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  34.17 
 
 
396 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  36.94 
 
 
466 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  36.94 
 
 
466 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  33.58 
 
 
638 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  36.94 
 
 
466 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  36.94 
 
 
466 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  36.94 
 
 
466 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  36.94 
 
 
466 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
700 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  36.94 
 
 
466 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
591 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.23 
 
 
456 aa  123  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  27.44 
 
 
646 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
475 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
393 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  35.71 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
775 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  36.36 
 
 
381 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
464 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
682 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.99 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  34.62 
 
 
501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1105  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
632 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.097468  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  36.44 
 
 
772 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
401 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  38.38 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  32.5 
 
 
456 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  34.75 
 
 
575 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  34.75 
 
 
575 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  34.75 
 
 
575 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
403 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  35.75 
 
 
412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.25 
 
 
683 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.49 
 
 
323 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
770 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
599 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
545 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  37.31 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  33 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  36.44 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
658 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  38.43 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
638 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
468 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
662 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
412 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  34.56 
 
 
662 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
1229 aa  114  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  36.89 
 
 
338 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  30 
 
 
339 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
591 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
485 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  35.44 
 
 
349 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  35.92 
 
 
363 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
640 aa  113  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>