58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1975 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 189 aa  367  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  95.36 
 
 		 374 aa  244  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  63.69 
 
 		 370 aa  212  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  54.12 
 
 		 354 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  43.55 
 
 		 348 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  49.65 
 
 		 348 aa  158  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  43.87 
 
 		 354 aa  141  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.47 
 
 		 358 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  54.81 
 
 		 364 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  51.43 
 
 		 360 aa  138  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  53.33 
 
 		 363 aa  137  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  45.93 
 
 		 372 aa  137  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.94 
 
 		 365 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.94 
 
 		 365 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.494626 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  48.91 
 
 		 742 aa  134  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.85 
 
 		 349 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  50 
 
 		 354 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  53.64 
 
 		 356 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.69 
 
 		 367 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  45.71 
 
 		 379 aa  124  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  56.67 
 
 		 331 aa  124  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  44.68 
 
 		 416 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  44.02 
 
 		 364 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  49.34 
 
 		 361 aa  121  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  48.53 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  50 
 
 		 351 aa  118  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.54 
 
 		 350 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  37.85 
 
 		 434 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  44.12 
 
 		 350 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  39.86 
 
 		 544 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  44.53 
 
 		 381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  55.63 
 
 		 358 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  44.2 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  41.67 
 
 		 599 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.99 
 
 		 366 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  40.67 
 
 		 370 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  46.51 
 
 		 689 aa  104  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  48.59 
 
 		 354 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  48.59 
 
 		 351 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  48.59 
 
 		 354 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  48.59 
 
 		 354 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  48.59 
 
 		 351 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  48.59 
 
 		 354 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  48.59 
 
 		 351 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  48.59 
 
 		 354 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  44.22 
 
 		 351 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  48.59 
 
 		 351 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  47.18 
 
 		 351 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  41.98 
 
 		 348 aa  99.4  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  43.17 
 
 		 388 aa  96.3  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  42.75 
 
 		 403 aa  94.4  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  35.61 
 
 		 1344 aa  89  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  50 
 
 		 356 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  32.03 
 
 		 1129 aa  87.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  39 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 967 aa  69.7  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  42.45 
 
 		 365 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228892 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  34.93 
 
 		 481 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>