More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1950 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  84.5 
 
 
556 aa  905    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  100 
 
 
530 aa  1063    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  60.72 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  46.69 
 
 
543 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  41.21 
 
 
527 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  42.54 
 
 
553 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  42.23 
 
 
522 aa  346  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  36.75 
 
 
560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  36.91 
 
 
556 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  35.33 
 
 
548 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  38.86 
 
 
565 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  35.46 
 
 
550 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  38.68 
 
 
568 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  37.17 
 
 
579 aa  293  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
553 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  33.77 
 
 
546 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  35.03 
 
 
556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  33.64 
 
 
552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  33.74 
 
 
619 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  39.03 
 
 
542 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  32.96 
 
 
522 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  32.96 
 
 
522 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  39 
 
 
536 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  32.46 
 
 
522 aa  279  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  32.58 
 
 
522 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  32.58 
 
 
522 aa  276  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  32.39 
 
 
522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  31.63 
 
 
522 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  32.39 
 
 
522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  39.6 
 
 
545 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  32.52 
 
 
522 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  39.93 
 
 
536 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  32.14 
 
 
522 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  32.83 
 
 
520 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  34.22 
 
 
583 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  32.7 
 
 
557 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  31.64 
 
 
544 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  37.02 
 
 
554 aa  263  8e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  39.22 
 
 
565 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.33 
 
 
540 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  34.96 
 
 
544 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  34.02 
 
 
563 aa  259  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  39.63 
 
 
532 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  37.01 
 
 
549 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  34.86 
 
 
545 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  36.6 
 
 
537 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  32.01 
 
 
543 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  35.26 
 
 
535 aa  248  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  38.49 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.6 
 
 
569 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  35.89 
 
 
573 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.9 
 
 
574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.97 
 
 
533 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  29.47 
 
 
539 aa  233  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  34.49 
 
 
548 aa  229  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.68 
 
 
553 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.93 
 
 
549 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  33.83 
 
 
542 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  37.07 
 
 
532 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 
584 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.5 
 
 
546 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.85 
 
 
539 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  31.46 
 
 
537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  34.4 
 
 
537 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  34.85 
 
 
548 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.51 
 
 
538 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  34.85 
 
 
548 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  34.85 
 
 
548 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  32.36 
 
 
560 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  32.72 
 
 
564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.89 
 
 
583 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.81 
 
 
520 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  33.51 
 
 
601 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  32.28 
 
 
564 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  31.5 
 
 
573 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.74 
 
 
564 aa  213  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  32.41 
 
 
543 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.91 
 
 
543 aa  212  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  30.22 
 
 
543 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  32.11 
 
 
543 aa  211  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.66 
 
 
540 aa  209  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  35.7 
 
 
538 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.71 
 
 
544 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  33.27 
 
 
539 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.42 
 
 
541 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  33.51 
 
 
565 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 
589 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  33.22 
 
 
551 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  31.43 
 
 
569 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  29.68 
 
 
585 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
565 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  29.25 
 
 
583 aa  203  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  29.25 
 
 
583 aa  203  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.8 
 
 
539 aa  203  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  31.31 
 
 
606 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  30.16 
 
 
608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.37 
 
 
564 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  28.47 
 
 
582 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  33.63 
 
 
544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  31.35 
 
 
616 aa  200  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>