More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1934 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 472 aa  956    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  84.4 
 
 		 470 aa  787    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 472 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 465 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 460 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 463 aa  179  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 465 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 460 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 494 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  29.36 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  30.37 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  31.04 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  32.52 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  28.54 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 427 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  28.57 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  30.86 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 457 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 464 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 491 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  31.43 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 437 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  29.16 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  28.47 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  28.41 
 
 		 462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  27.63 
 
 		 470 aa  156  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  31.38 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 462 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 521 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  30.19 
 
 		 463 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  30.42 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 469 aa  156  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 456 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 456 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  32.92 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  31.3 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  31.78 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5122  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 475 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  28.31 
 
 		 480 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  28.61 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.95 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  31.25 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  30.86 
 
 		 430 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  30.86 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  27.18 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 437 aa  150  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>