More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1927 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
236 aa  446  1e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  84.58 
 
 
228 aa  361  7e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.46 
 
 
221 aa  188  6e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.44 
 
 
210 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  7.28866e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.44 
 
 
223 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.38 
 
 
211 aa  177  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.5 
 
 
211 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.99 
 
 
215 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.46383e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.02 
 
 
221 aa  174  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  42.93 
 
 
209 aa  174  1e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.85 
 
 
211 aa  173  2e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.21 
 
 
207 aa  171  7e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.77 
 
 
216 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.1 
 
 
210 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.7 
 
 
206 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.22 
 
 
219 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  46.15 
 
 
213 aa  166  3e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.15 
 
 
206 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  45 
 
 
212 aa  165  7e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.54 
 
 
220 aa  165  7e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.51 
 
 
209 aa  164  2e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.27 
 
 
216 aa  161  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  43.48 
 
 
210 aa  160  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  9.01813e-06 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.85 
 
 
217 aa  158  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.7 
 
 
218 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.81 
 
 
343 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.23 
 
 
219 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.57 
 
 
214 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.7 
 
 
218 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.73 
 
 
211 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  43.52 
 
 
217 aa  152  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.24 
 
 
197 aa  152  6e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.28 
 
 
219 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.73 
 
 
213 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.25 
 
 
211 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47 
 
 
344 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.79 
 
 
222 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
218 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  4.7745e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.72 
 
 
252 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
208 aa  148  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.65 
 
 
356 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.41 
 
 
207 aa  147  1e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.1 
 
 
205 aa  146  2e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
206 aa  147  2e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.95 
 
 
224 aa  146  2e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.22 
 
 
213 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.51 
 
 
220 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.34 
 
 
216 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.49 
 
 
204 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.62 
 
 
206 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  46.24 
 
 
478 aa  144  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  39.49 
 
 
204 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
217 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.78 
 
 
206 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.62 
 
 
223 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.18 
 
 
220 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.38 
 
 
226 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.69 
 
 
360 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.82 
 
 
212 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.93 
 
 
207 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.95 
 
 
206 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.81 
 
 
353 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0403  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.73 
 
 
211 aa  140  1e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.647684  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.7 
 
 
207 aa  140  1e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.24 
 
 
214 aa  140  2e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.59 
 
 
352 aa  140  2e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.44 
 
 
343 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.44 
 
 
343 aa  139  4e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.11 
 
 
202 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
219 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  44.1 
 
 
492 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.53 
 
 
219 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.12 
 
 
206 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.76 
 
 
224 aa  136  3e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.53 
 
 
219 aa  136  3e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.15 
 
 
206 aa  136  3e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.03 
 
 
212 aa  136  3e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.11 
 
 
352 aa  135  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  7.36904e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.93 
 
 
207 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
219 aa  135  7e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09340  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.93 
 
 
231 aa  135  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.31723 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.01 
 
 
217 aa  134  1e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.06 
 
 
204 aa  134  1e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.89 
 
 
211 aa  134  1e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77822  predicted protein  35.45 
 
 
533 aa  134  2e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00729956  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
219 aa  134  2e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.7 
 
 
221 aa  133  2e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
211 aa  133  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  44.28 
 
 
208 aa  134  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
222 aa  134  2e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  42.05 
 
 
479 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.31 
 
 
346 aa  132  4e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.05 
 
 
219 aa  132  4e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.18 
 
 
350 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.66 
 
 
215 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.47 
 
 
219 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.47 
 
 
219 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 
490 aa  131  8e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.49 
 
 
208 aa  131  8e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.38 
 
 
216 aa  131  8e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>