More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1899 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  85.94 
 
 		 944 aa  1645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.99 
 
 		 934 aa  1129    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 956 aa  1939    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.54 
 
 		 927 aa  942    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.08 
 
 		 960 aa  732    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.33 
 
 		 930 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.64 
 
 		 921 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.81 
 
 		 957 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.84 
 
 		 952 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  39.65 
 
 		 838 aa  483  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.48 
 
 		 921 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.54 
 
 		 929 aa  465  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  33.19 
 
 		 929 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.06 
 
 		 934 aa  459  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.96 
 
 		 934 aa  458  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.06 
 
 		 934 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.23 
 
 		 934 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.06 
 
 		 934 aa  459  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.96 
 
 		 934 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  39.33 
 
 		 840 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.12 
 
 		 934 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.78 
 
 		 934 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.63 
 
 		 934 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  38.02 
 
 		 876 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.6 
 
 		 934 aa  445  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  37.55 
 
 		 843 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  38.24 
 
 		 830 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  37.43 
 
 		 830 aa  435  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  37.08 
 
 		 843 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  37.87 
 
 		 851 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  33.84 
 
 		 822 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  33.38 
 
 		 832 aa  399  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  36.23 
 
 		 729 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  31.99 
 
 		 846 aa  382  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  32.01 
 
 		 709 aa  365  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.09 
 
 		 966 aa  363  8e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  37.17 
 
 		 631 aa  357  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  35.7 
 
 		 643 aa  357  6.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  37.12 
 
 		 633 aa  356  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  36.97 
 
 		 633 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  34.82 
 
 		 658 aa  355  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  35.6 
 
 		 660 aa  346  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  35.86 
 
 		 651 aa  345  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  34.85 
 
 		 659 aa  345  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.33 
 
 		 641 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  28.77 
 
 		 1043 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.11 
 
 		 978 aa  344  5e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  34.6 
 
 		 640 aa  342  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  34.14 
 
 		 646 aa  335  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  34.09 
 
 		 646 aa  334  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  34.65 
 
 		 653 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  32.94 
 
 		 639 aa  330  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.81 
 
 		 707 aa  330  8e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  33.24 
 
 		 652 aa  330  9e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  37 
 
 		 635 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.29 
 
 		 636 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.29 
 
 		 636 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.29 
 
 		 636 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.29 
 
 		 636 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.29 
 
 		 636 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.29 
 
 		 636 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  32.65 
 
 		 652 aa  328  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.29 
 
 		 636 aa  327  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  32.79 
 
 		 755 aa  327  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.15 
 
 		 636 aa  325  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  31.27 
 
 		 681 aa  324  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.15 
 
 		 636 aa  323  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  32.48 
 
 		 751 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  33.53 
 
 		 636 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.34 
 
 		 644 aa  322  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  35.12 
 
 		 675 aa  322  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  32.59 
 
 		 640 aa  322  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  32.7 
 
 		 636 aa  319  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  32.18 
 
 		 662 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.13 
 
 		 897 aa  318  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.13 
 
 		 897 aa  318  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  33.64 
 
 		 757 aa  318  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.92 
 
 		 636 aa  318  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  35.15 
 
 		 645 aa  317  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.92 
 
 		 636 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.92 
 
 		 636 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  34.48 
 
 		 670 aa  317  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.92 
 
 		 636 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  34.88 
 
 		 641 aa  316  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  34.88 
 
 		 641 aa  316  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  28.9 
 
 		 667 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  31.42 
 
 		 668 aa  314  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.31 
 
 		 651 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  33.52 
 
 		 698 aa  310  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  33.52 
 
 		 661 aa  304  5.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  32.86 
 
 		 629 aa  299  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  33.66 
 
 		 639 aa  296  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  33.19 
 
 		 664 aa  296  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.41 
 
 		 954 aa  295  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  30.79 
 
 		 647 aa  292  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  33.62 
 
 		 675 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  31.81 
 
 		 644 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  33.62 
 
 		 675 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  31.71 
 
 		 636 aa  288  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  33.43 
 
 		 673 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>