More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1888 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  100 
 
 		 334 aa  672    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  95.51 
 
 		 334 aa  644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  82.97 
 
 		 333 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  70.94 
 
 		 329 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.63 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.26 
 
 		 325 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  57.19 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.25 
 
 		 341 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.73 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.52 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.94 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.82 
 
 		 308 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.57 
 
 		 334 aa  325  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  50.78 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  50.32 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  52.26 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.27 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  48.04 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 		 349 aa  312  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.65 
 
 		 320 aa  312  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  50.82 
 
 		 343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  51.3 
 
 		 338 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.42 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 		 320 aa  308  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.82 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  48.69 
 
 		 339 aa  305  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.87 
 
 		 379 aa  305  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  47.73 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  45.17 
 
 		 317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  45.62 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.34 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  46.6 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  48.03 
 
 		 349 aa  289  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.49 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  46.91 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  46.84 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  46.77 
 
 		 337 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  46.41 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  49.01 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  46.52 
 
 		 335 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  46.06 
 
 		 335 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  45.99 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.56 
 
 		 313 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  45.98 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  45.92 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  46.32 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  45.92 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.48 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  45.32 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.31 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.94 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.37 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  46.73 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.05 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.37 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  43.29 
 
 		 342 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  46.13 
 
 		 332 aa  268  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  48.62 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.22 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.62 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  42.58 
 
 		 315 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.28 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.98 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  47.25 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  46 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.48 
 
 		 341 aa  264  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.98 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  44.41 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  46.28 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.3 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.42 
 
 		 331 aa  262  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  43.14 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  43.18 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  42.32 
 
 		 340 aa  259  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  44.2 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  42.49 
 
 		 337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  44.37 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  43.61 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  43.51 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  43.65 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  44.01 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  43.42 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.99 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  41.96 
 
 		 330 aa  256  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.58 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  43.4 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.52 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.36 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  44.86 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  45.25 
 
 		 362 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  46.08 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  46.23 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  45.39 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>