More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1852 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  93.78 
 
 
370 aa  720    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  100 
 
 
370 aa  756    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  68.65 
 
 
370 aa  547  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  42.28 
 
 
841 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  40.38 
 
 
842 aa  306  5.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  44.57 
 
 
361 aa  305  7e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  42.43 
 
 
366 aa  305  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.38 
 
 
842 aa  302  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  41.94 
 
 
833 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  40.11 
 
 
840 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  39.4 
 
 
816 aa  299  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  43.33 
 
 
361 aa  298  8e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  41.1 
 
 
832 aa  298  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  43.73 
 
 
361 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  40.28 
 
 
828 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  41.1 
 
 
832 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  38.84 
 
 
818 aa  295  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  40.39 
 
 
820 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  40.83 
 
 
832 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  41.39 
 
 
841 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  40.22 
 
 
835 aa  292  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  39.83 
 
 
830 aa  291  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  40.55 
 
 
830 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  39.02 
 
 
843 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  39.45 
 
 
842 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  41.23 
 
 
818 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  42.47 
 
 
367 aa  285  9e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  38.21 
 
 
776 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  40.92 
 
 
821 aa  281  9e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  37.57 
 
 
835 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  38.72 
 
 
854 aa  281  2e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  39.72 
 
 
827 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  39.72 
 
 
834 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
785 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  38.87 
 
 
828 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  37.02 
 
 
836 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  38.61 
 
 
843 aa  275  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  42.46 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  35.85 
 
 
835 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  35.14 
 
 
835 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  36.51 
 
 
820 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  35.05 
 
 
784 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  35.05 
 
 
784 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  35.05 
 
 
784 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  37.29 
 
 
836 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.05 
 
 
784 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.05 
 
 
784 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.87 
 
 
828 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.19 
 
 
836 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  35.87 
 
 
784 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  35.87 
 
 
784 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  34.24 
 
 
784 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  34.24 
 
 
784 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  35.33 
 
 
784 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  36.11 
 
 
810 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  36.86 
 
 
827 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  35.95 
 
 
828 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  41.09 
 
 
349 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.36 
 
 
836 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  41.41 
 
 
347 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  38.58 
 
 
348 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.46 
 
 
842 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  36.76 
 
 
712 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  39.71 
 
 
346 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  36.9 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
363 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.11 
 
 
837 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  34.4 
 
 
392 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
833 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  36.63 
 
 
365 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  37.7 
 
 
357 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  36 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
370 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
359 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  38.14 
 
 
326 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  37.6 
 
 
359 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
399 aa  230  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
359 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
364 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.61 
 
 
343 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  34.75 
 
 
359 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  34.04 
 
 
392 aa  226  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.56 
 
 
364 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  34.28 
 
 
392 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  35.66 
 
 
359 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
387 aa  222  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
359 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
359 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
359 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  34.34 
 
 
387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  34.34 
 
 
381 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.89 
 
 
389 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.17 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
392 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  34.71 
 
 
388 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.17 
 
 
392 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.76 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.17 
 
 
392 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>