31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1828 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  90.68 
 
 		 445 aa  830    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  100 
 
 		 458 aa  951    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 698 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2424  hypothetical protein  28.81 
 
 		 391 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.481208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1793  hypothetical protein  29.16 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0265229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  31.25 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  29.44 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  28.67 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1537  hypothetical protein  27.59 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.522426  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  23.86 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1847  putative neutral invertase-like protein  21.1 
 
 		 485 aa  53.9  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.570169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  32.7 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  31.87 
 
 		 474 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  29.92 
 
 		 834 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0397  putative neutral invertase  24.51 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  32.48 
 
 		 668 aa  47  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.75 
 
 		 868 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.18 
 
 		 781 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21831  putative neutral invertase-like protein  29.56 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  23.94 
 
 		 610 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  26.81 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  23.02 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  30.38 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03631  putative neutral invertase-like protein  21.19 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0487  putative neutral invertase-like protein  21.83 
 
 		 485 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.782741  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2298  hypothetical protein  24.27 
 
 		 827 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1704  putative neutral invertase-like protein  20.33 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04191  putative neutral invertase-like protein  20.33 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  32.53 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.74 
 
 		 731 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  23.86 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>