More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1819 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 571 aa  1129    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  78.33 
 
 		 561 aa  819    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  45.89 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.65 
 
 		 649 aa  286  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.37 
 
 		 831 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  32.8 
 
 		 566 aa  277  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.8 
 
 		 604 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  38.34 
 
 		 834 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  35.11 
 
 		 569 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.42 
 
 		 566 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.82 
 
 		 562 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.47 
 
 		 834 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.4 
 
 		 563 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.13 
 
 		 834 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31 
 
 		 605 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.01 
 
 		 595 aa  226  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  32.24 
 
 		 608 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  31.05 
 
 		 583 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  31.39 
 
 		 513 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  33.33 
 
 		 623 aa  217  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.33 
 
 		 587 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.91 
 
 		 570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29 
 
 		 589 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.98 
 
 		 593 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.98 
 
 		 593 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  29.89 
 
 		 611 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0654  peptidase S49  35.01 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.900238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.04 
 
 		 598 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.04 
 
 		 598 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.75 
 
 		 561 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.06 
 
 		 875 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.06 
 
 		 590 aa  204  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.98 
 
 		 593 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.11 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  31.37 
 
 		 609 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.76 
 
 		 590 aa  200  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  33.48 
 
 		 593 aa  200  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.12 
 
 		 595 aa  199  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.06 
 
 		 588 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  30.96 
 
 		 601 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.49 
 
 		 656 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.13 
 
 		 595 aa  193  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  30.6 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.9 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  29.91 
 
 		 621 aa  187  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.05 
 
 		 594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.16 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.87 
 
 		 617 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.59 
 
 		 597 aa  183  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.07 
 
 		 651 aa  183  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0494755  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.88 
 
 		 614 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  28.87 
 
 		 616 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  29.27 
 
 		 601 aa  180  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.21 
 
 		 613 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.66 
 
 		 614 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.66 
 
 		 614 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  30.68 
 
 		 580 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.58 
 
 		 547 aa  177  6e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.57 
 
 		 614 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  30.35 
 
 		 610 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.06 
 
 		 615 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.76 
 
 		 613 aa  174  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  30.32 
 
 		 612 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  31.07 
 
 		 617 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.07 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.07 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.07 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.42 
 
 		 597 aa  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  28.1 
 
 		 616 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  26.96 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.83 
 
 		 596 aa  171  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.67 
 
 		 611 aa  169  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.2 
 
 		 629 aa  169  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.16 
 
 		 615 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  27.76 
 
 		 618 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  27.76 
 
 		 618 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  27.57 
 
 		 622 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.76 
 
 		 618 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  27.57 
 
 		 618 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  27.57 
 
 		 618 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  27.57 
 
 		 618 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.61 
 
 		 613 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.88 
 
 		 595 aa  164  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.79 
 
 		 640 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  27.38 
 
 		 618 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.21 
 
 		 613 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.67 
 
 		 616 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  26.51 
 
 		 616 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.47 
 
 		 620 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  27.86 
 
 		 616 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  26.51 
 
 		 616 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.99 
 
 		 621 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  26.51 
 
 		 616 aa  158  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  27.56 
 
 		 618 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.57 
 
 		 637 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  27.1 
 
 		 618 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  27.56 
 
 		 618 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  27.58 
 
 		 609 aa  156  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  27.35 
 
 		 618 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  27.35 
 
 		 618 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>