More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1813 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  78.26 
 
 
394 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 
283 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
284 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  33.7 
 
 
283 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
277 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
283 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  30.04 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
267 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  29.85 
 
 
285 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  35.64 
 
 
287 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
260 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  29.96 
 
 
279 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  35.36 
 
 
283 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.91 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.9 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1055  alpha/beta hydrolase  33.16 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.94 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.16 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.44 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.78 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.44 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  23.99 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  27.24 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.83 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  26.69 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.66 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  32.45 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  38.58 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.66 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  35.04 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2086  twin-arginine translocation pathway signal  25.54 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  21.71 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  26.59 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.47 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  28.21 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  22.06 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  22.83 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  38.46 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  22.3 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.9 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  36.75 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  28.22 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  28.11 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.04 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>