More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1796 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  100 
 
 		 393 aa  789    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  74.19 
 
 		 398 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  55.31 
 
 		 385 aa  398  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  40.54 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0570  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.9 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.13 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.87 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.12 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  33.33 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  33.9 
 
 		 380 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.19 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  33.62 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  35.5 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  35.05 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  42.48 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1935  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.77 
 
 		 357 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786432  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  36.74 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  37.54 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.01 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 357 aa  196  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  38.01 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  42.65 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  40 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  36.92 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  40.29 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.09 
 
 		 370 aa  192  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  40 
 
 		 364 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  35.67 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.65 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  36.6 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.66 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  37.58 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.29 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1159  ABC transporter related  35.74 
 
 		 364 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000201469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1181  ABC transporter related  35.74 
 
 		 364 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000170044  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.05 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  38.28 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  35.1 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.54 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 405 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  35.61 
 
 		 377 aa  190  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.27 
 
 		 354 aa  189  5e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 353 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  32.17 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  37.58 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  34.41 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  41.95 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  39.72 
 
 		 353 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5131  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.73 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.25 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 		 615 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  40.48 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.1 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.21 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  37.95 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.81 
 
 		 355 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.88 
 
 		 364 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 		 350 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2426  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.5 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.444349  normal  0.105607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  38.21 
 
 		 352 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.8 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  36.15 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  37.37 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.54 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  39.13 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  38.46 
 
 		 347 aa  188  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.88 
 
 		 364 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  37.17 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  34.78 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.13 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.68 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  34.78 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  36.88 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  34.78 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 378 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  38.57 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  38.19 
 
 		 345 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.8 
 
 		 364 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  37.54 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  34.33 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  38.11 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.45 
 
 		 378 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  36.3 
 
 		 367 aa  187  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.45 
 
 		 378 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  43.81 
 
 		 209 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 		 604 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>