More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1768 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  67.47 
 
 
506 aa  706    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  67.34 
 
 
497 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  68.2 
 
 
504 aa  687    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  62.73 
 
 
504 aa  655    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  63.71 
 
 
500 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  64.53 
 
 
499 aa  670    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  78.11 
 
 
498 aa  796    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  62.85 
 
 
500 aa  634    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  64.17 
 
 
502 aa  638    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  67 
 
 
505 aa  705    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  64.46 
 
 
510 aa  655    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  63.65 
 
 
505 aa  676    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  100 
 
 
498 aa  1029    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  63.65 
 
 
505 aa  671    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  65.8 
 
 
504 aa  685    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  66.2 
 
 
504 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  61.83 
 
 
505 aa  641    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  62.9 
 
 
507 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  63.47 
 
 
514 aa  677    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  66.8 
 
 
504 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  62.85 
 
 
509 aa  639    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  63.62 
 
 
503 aa  684    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  67.47 
 
 
505 aa  681    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  61.92 
 
 
499 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  62.7 
 
 
501 aa  661    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  67.74 
 
 
503 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  63.91 
 
 
499 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  64.98 
 
 
496 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  63.25 
 
 
499 aa  644    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  68.46 
 
 
504 aa  705    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  64.73 
 
 
499 aa  657    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  62.82 
 
 
505 aa  674    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  60.83 
 
 
510 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  62.12 
 
 
499 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  60.61 
 
 
507 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  60.24 
 
 
510 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  60.24 
 
 
510 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  61.45 
 
 
501 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  61.37 
 
 
507 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  61.24 
 
 
501 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  60.8 
 
 
497 aa  625  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  61.24 
 
 
501 aa  623  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  60.2 
 
 
507 aa  622  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  61.17 
 
 
505 aa  624  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  59.48 
 
 
496 aa  615  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  60.56 
 
 
517 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  59.92 
 
 
509 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  62.03 
 
 
505 aa  609  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  62.03 
 
 
505 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  62.03 
 
 
505 aa  610  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  59.27 
 
 
496 aa  609  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  61.43 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  61.43 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  61.63 
 
 
505 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  61.43 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  61.63 
 
 
506 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  58.59 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  58.7 
 
 
522 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  57 
 
 
498 aa  598  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  60.88 
 
 
510 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  59.88 
 
 
501 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  58.66 
 
 
514 aa  587  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  57.09 
 
 
494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  57.03 
 
 
494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  55.04 
 
 
496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  57.29 
 
 
494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  56.54 
 
 
496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  57.09 
 
 
494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  57.09 
 
 
494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  56.68 
 
 
494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  56.91 
 
 
501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  57.09 
 
 
494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  56.88 
 
 
494 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  55.73 
 
 
520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  54.64 
 
 
496 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  57.09 
 
 
494 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  56.12 
 
 
498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  56.88 
 
 
494 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  55.8 
 
 
502 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  54.62 
 
 
499 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  54.23 
 
 
496 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  54.23 
 
 
496 aa  568  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  54.23 
 
 
496 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  56.43 
 
 
505 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  55.82 
 
 
502 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  56.25 
 
 
495 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  55.42 
 
 
502 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  55.82 
 
 
502 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  55.82 
 
 
502 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  55.82 
 
 
502 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  54.23 
 
 
496 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  55.78 
 
 
493 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  53.43 
 
 
498 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  55.22 
 
 
502 aa  567  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  55.85 
 
 
499 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  53.43 
 
 
498 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  56.07 
 
 
500 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  53.01 
 
 
505 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  54.82 
 
 
507 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.63 
 
 
496 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>