113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1762 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1762  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2035  hypothetical protein  88.39 
 
 		 278 aa  494  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0067  hypothetical protein  36.55 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4882  hypothetical protein  28.44 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  33.89 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  30.84 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  29.41 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  36.93 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3882  hypothetical protein  28.83 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000462301  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  33.88 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  30.45 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  35.59 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  35.45 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  31.72 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  31.25 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  34.66 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  32.19 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  34.83 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  32.44 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  29.88 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  31.58 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  28.38 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  32.38 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  28.06 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  29.78 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  33.9 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  27.93 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  34.24 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  32.26 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  34.29 
 
 		 182 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  30.04 
 
 		 283 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  35.67 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  34.83 
 
 		 280 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  33.89 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  29.17 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  30.87 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  30.37 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3589  protein of unknown function DUF574  29.25 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.801624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  33.16 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  33.89 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  30.97 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  33.52 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  35.61 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  30.47 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  31.51 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  27.55 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  29.23 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  27.24 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  33.15 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  32.13 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  34.39 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  28.23 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  31.42 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  30.94 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  28.36 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  34.09 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  28.64 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  29.67 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  30.89 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  32.43 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  28.37 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  29.96 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  31.82 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  31.55 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  26.79 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  31.67 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  30.29 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4033  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  29 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  32.02 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  28.9 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  29.19 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  27.13 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  28.23 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  32.29 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3635  hypothetical protein  41.41 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  30.36 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  28.49 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  28.38 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  36.16 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  34.11 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  31.25 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  27.71 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  30.95 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  29.55 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  31.94 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  24.9 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0569  hypothetical protein  39.39 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  30.04 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  27.19 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  35.77 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  26.23 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  30.43 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  28.34 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  34.43 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1531  hypothetical protein  36.73 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0233164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>