More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1699 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  96.24 
 
 
213 aa  417  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  73.24 
 
 
213 aa  323  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  70.89 
 
 
213 aa  303  9e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
214 aa  164  1e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
211 aa  148  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 
209 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
208 aa  147  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 
209 aa  147  1e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.64 
 
 
213 aa  146  2e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 
237 aa  139  4e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.75 
 
 
443 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 
459 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  39.32 
 
 
442 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
212 aa  135  6e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.78 
 
 
442 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  39.61 
 
 
214 aa  134  1e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.78 
 
 
442 aa  133  2e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
448 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.29 
 
 
442 aa  132  4e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.89 
 
 
444 aa  131  7e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  39.7 
 
 
214 aa  131  8e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.8 
 
 
442 aa  130  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35 
 
 
202 aa  130  1e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
214 aa  130  2e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
445 aa  130  2e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 
448 aa  130  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
449 aa  129  4e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.64 
 
 
205 aa  128  5e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.31 
 
 
442 aa  129  5e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
447 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
452 aa  124  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
447 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 
209 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
217 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.75 
 
 
547 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.37 
 
 
442 aa  118  5e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 
206 aa  117  2e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
209 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 
221 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
217 aa  115  7e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
211 aa  113  2e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  8.5953e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 
214 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  1.19918e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 
220 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
201 aa  111  7e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
201 aa  111  7e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 
214 aa  111  7e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  4.42989e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.5 
 
 
378 aa  110  2e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 
440 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.84 
 
 
200 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.81703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.31 
 
 
196 aa  108  4e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.5335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 
370 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.75954e-05  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33 
 
 
200 aa  108  7e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.1297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.46 
 
 
203 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
212 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.78 
 
 
222 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
207 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.44 
 
 
203 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
235 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  32.65 
 
 
207 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
222 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.93 
 
 
203 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.93 
 
 
203 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36 
 
 
427 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.93 
 
 
203 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.34 
 
 
200 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.34 
 
 
200 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 
240 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 
200 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.84 
 
 
378 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
225 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 
226 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.43 
 
 
203 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
412 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
240 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 
226 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 
213 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 
224 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
208 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
207 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.49 
 
 
233 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 
212 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 
212 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
207 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.63 
 
 
203 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
207 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.63 
 
 
203 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 
228 aa  101  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
274 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
402 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
223 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  36.07 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 
200 aa  99.4  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.17 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
201 aa  98.2  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.43 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.40837e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
253 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>