148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1654 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 974 aa  1977    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  85.71 
 
 		 554 aa  847    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.15 
 
 		 630 aa  229  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  86.92 
 
 		 274 aa  194  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  85.05 
 
 		 309 aa  190  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  39.71 
 
 		 280 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  46.67 
 
 		 405 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  51.38 
 
 		 242 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1126 aa  101  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  48.28 
 
 		 923 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  55.43 
 
 		 495 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  60.23 
 
 		 1058 aa  100  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1333 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1246 aa  99  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  42.65 
 
 		 569 aa  97.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  44.27 
 
 		 1060 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  56.1 
 
 		 239 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  49.49 
 
 		 1448 aa  95.5  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  49.57 
 
 		 756 aa  94.7  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  52.08 
 
 		 224 aa  92.8  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  52.27 
 
 		 386 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  57.32 
 
 		 243 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1200 aa  90.1  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  43.09 
 
 		 968 aa  89  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  51.22 
 
 		 258 aa  89  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1202 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  51.14 
 
 		 1086 aa  84  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  41.13 
 
 		 1319 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  82.4  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  36.69 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  49.4 
 
 		 1403 aa  80.1  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  46.15 
 
 		 222 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  57.53 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  51.19 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  53.85 
 
 		 313 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  40.5 
 
 		 896 aa  75.1  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  50 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  36.24 
 
 		 693 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  53.66 
 
 		 238 aa  73.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  51.76 
 
 		 643 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  42.06 
 
 		 1137 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  48.86 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  55.84 
 
 		 1198 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.7 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.93 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  41.88 
 
 		 1217 aa  71.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  51.39 
 
 		 234 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  52.7 
 
 		 1309 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  42.05 
 
 		 909 aa  69.3  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  50 
 
 		 922 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  46.91 
 
 		 935 aa  69.3  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  48.78 
 
 		 1219 aa  69.3  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.39 
 
 		 913 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  43.75 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  49.25 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  51.52 
 
 		 423 aa  67.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  48.28 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  36.67 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  42.68 
 
 		 534 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 422 aa  64.3  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  35.83 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  49.23 
 
 		 595 aa  62.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  35.34 
 
 		 582 aa  62  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  51.52 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.97 
 
 		 280 aa  60.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 334 aa  60.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  35.71 
 
 		 2221 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  36.8 
 
 		 1081 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.11 
 
 		 762 aa  58.9  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  46.25 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  53.45 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  51.67 
 
 		 462 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  44.16 
 
 		 723 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.25 
 
 		 128 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 77 aa  56.6  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  43.24 
 
 		 228 aa  55.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  39.76 
 
 		 642 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  48.48 
 
 		 866 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.47 
 
 		 266 aa  55.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.98 
 
 		 256 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  41.18 
 
 		 239 aa  55.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 		 319 aa  54.7  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 266 aa  54.7  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.27 
 
 		 160 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  44.29 
 
 		 204 aa  53.9  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.19 
 
 		 294 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 300 aa  53.5  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.78 
 
 		 283 aa  53.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.15 
 
 		 224 aa  53.5  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  37.21 
 
 		 409 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  52 
 
 		 201 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2841  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.4 
 
 		 554 aa  52.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157478  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 1089 aa  51.6  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.67 
 
 		 234 aa  52  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.33 
 
 		 372 aa  51.6  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  39.39 
 
 		 3036 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 322 aa  51.6  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.31 
 
 		 792 aa  51.6  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>