More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1628 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  100 
 
 		 722 aa  1457    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  70.62 
 
 		 719 aa  942    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  95.57 
 
 		 722 aa  1340    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  48.29 
 
 		 637 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  50 
 
 		 759 aa  609  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  48.79 
 
 		 729 aa  595  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  50.15 
 
 		 760 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  45.61 
 
 		 681 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  44.12 
 
 		 713 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  44.91 
 
 		 703 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  43.67 
 
 		 705 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  45.42 
 
 		 678 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  40.87 
 
 		 703 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  42.35 
 
 		 726 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  41.71 
 
 		 688 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  41.5 
 
 		 687 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  40.7 
 
 		 687 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  40.16 
 
 		 683 aa  485  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  41.87 
 
 		 671 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  41.46 
 
 		 671 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.46 
 
 		 671 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.46 
 
 		 671 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  41.33 
 
 		 807 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.33 
 
 		 671 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.46 
 
 		 671 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  40.35 
 
 		 672 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  40.81 
 
 		 671 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  40.81 
 
 		 671 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  41.46 
 
 		 671 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  43.26 
 
 		 593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  40.62 
 
 		 683 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  40.68 
 
 		 671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  40.08 
 
 		 672 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.22 
 
 		 672 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  40.68 
 
 		 671 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  40.2 
 
 		 614 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  39.81 
 
 		 702 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  40.54 
 
 		 671 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  39.92 
 
 		 699 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  40.54 
 
 		 671 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  43.98 
 
 		 590 aa  457  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  40.54 
 
 		 671 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5062  Na+/solute symporter  38.94 
 
 		 699 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  42.75 
 
 		 589 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  43.96 
 
 		 591 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  41.4 
 
 		 769 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  42.47 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  42.11 
 
 		 594 aa  428  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  42.36 
 
 		 575 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  39.38 
 
 		 573 aa  425  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  40.09 
 
 		 586 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2877  Na+/solute symporter  39.32 
 
 		 695 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.81009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2364  Calcium-binding EF-hand-containing protein  39.46 
 
 		 695 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  42.3 
 
 		 591 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  41.87 
 
 		 551 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  41.82 
 
 		 559 aa  416  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  40 
 
 		 609 aa  415  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  38.62 
 
 		 568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  38.66 
 
 		 567 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.36 
 
 		 560 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  38.96 
 
 		 566 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1384  Na+/solute symporter  39.44 
 
 		 676 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.604499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  41.99 
 
 		 619 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  42.81 
 
 		 563 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  38.12 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  37.99 
 
 		 572 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  38.44 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  39.55 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  39.17 
 
 		 578 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  39.85 
 
 		 578 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  39.76 
 
 		 578 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  37.69 
 
 		 592 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  39.85 
 
 		 578 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  38.31 
 
 		 572 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  38.8 
 
 		 589 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  38.89 
 
 		 578 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  38.89 
 
 		 578 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  38.89 
 
 		 578 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.66 
 
 		 582 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  38.2 
 
 		 572 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  37.92 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  39.64 
 
 		 575 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  40.09 
 
 		 575 aa  389  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  38.89 
 
 		 578 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  38.52 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  38.17 
 
 		 618 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  40.81 
 
 		 582 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  41.11 
 
 		 582 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  38.34 
 
 		 589 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  39.15 
 
 		 622 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  40.06 
 
 		 622 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  38.65 
 
 		 622 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  37.29 
 
 		 572 aa  379  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  38.72 
 
 		 604 aa  372  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  38.7 
 
 		 603 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  39.19 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  39.2 
 
 		 588 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  37.82 
 
 		 596 aa  364  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  38.44 
 
 		 605 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  38.29 
 
 		 605 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>