More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1617 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3139  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  78.51 
 
 
458 aa  752    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00749895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1617  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
470 aa  963    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00988833  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  96.34 
 
 
470 aa  919    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599581  normal  0.35369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  36.78 
 
 
467 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.85 
 
 
467 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.61 
 
 
464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  36.96 
 
 
470 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  35.64 
 
 
440 aa  270  4e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.19 
 
 
466 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  36.88 
 
 
466 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.39 
 
 
464 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.08 
 
 
466 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.08 
 
 
466 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  37.08 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  38.02 
 
 
437 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  38.02 
 
 
437 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.81 
 
 
466 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  39.01 
 
 
464 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.39 
 
 
442 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.66 
 
 
438 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.25 
 
 
466 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  38.79 
 
 
464 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.45 
 
 
459 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  36.46 
 
 
466 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.82 
 
 
438 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.58 
 
 
457 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  37.31 
 
 
446 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.45 
 
 
447 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.17 
 
 
445 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  36.91 
 
 
440 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.53 
 
 
446 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  35.18 
 
 
470 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.18 
 
 
470 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.18 
 
 
470 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.13 
 
 
452 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.4 
 
 
466 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  35.53 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  36.8 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.82 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  36.15 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  37.63 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.28 
 
 
446 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  36.49 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  35.53 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.4 
 
 
466 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  35.84 
 
 
449 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  35.23 
 
 
470 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.97 
 
 
470 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  35.84 
 
 
454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  35.41 
 
 
454 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  34.89 
 
 
470 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.18 
 
 
457 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.02 
 
 
470 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  35.78 
 
 
476 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  36.26 
 
 
438 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  36.93 
 
 
445 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.19 
 
 
466 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.19 
 
 
466 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  35.7 
 
 
450 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.7 
 
 
450 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.19 
 
 
466 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.19 
 
 
466 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  34.85 
 
 
433 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  37.17 
 
 
445 aa  249  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  35.36 
 
 
440 aa  249  7e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  35.04 
 
 
453 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.53 
 
 
442 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  35.71 
 
 
440 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.23 
 
 
439 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.9 
 
 
458 aa  249  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.93 
 
 
463 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.06 
 
 
436 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  36.44 
 
 
445 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.52 
 
 
440 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.58 
 
 
437 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  32.76 
 
 
438 aa  248  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.59 
 
 
482 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.18 
 
 
457 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  34.42 
 
 
442 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  36.62 
 
 
435 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  36.62 
 
 
436 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.34 
 
 
457 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  36.36 
 
 
440 aa  247  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  34.19 
 
 
444 aa  247  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.77 
 
 
473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.77 
 
 
440 aa  246  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.77 
 
 
440 aa  246  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.85 
 
 
452 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  35.12 
 
 
522 aa  245  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  36.12 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.64 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.56 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.22 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  35.89 
 
 
438 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  36.29 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.6 
 
 
438 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  35.89 
 
 
438 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  34.42 
 
 
441 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  35.11 
 
 
482 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  31.93 
 
 
427 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>