More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1587 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  86.33 
 
 
279 aa  495  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  52.54 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  52.54 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  52.54 
 
 
276 aa  288  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  51.25 
 
 
283 aa  288  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  51.25 
 
 
283 aa  288  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  52.55 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  52.92 
 
 
278 aa  285  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  53.51 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  52.35 
 
 
278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  52.19 
 
 
276 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  52.19 
 
 
276 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  50.36 
 
 
276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  49.82 
 
 
286 aa  261  8.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.19 
 
 
265 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.42 
 
 
257 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.01 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.2 
 
 
264 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.85 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.83 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.67 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.83 
 
 
257 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.83 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.8 
 
 
262 aa  231  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.8 
 
 
271 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.25 
 
 
260 aa  230  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.25 
 
 
260 aa  230  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.27 
 
 
269 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.64 
 
 
263 aa  228  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.64 
 
 
263 aa  228  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.21 
 
 
262 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50 
 
 
273 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.64 
 
 
262 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50 
 
 
258 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.83 
 
 
262 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.18 
 
 
263 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.27 
 
 
262 aa  225  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50 
 
 
256 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.02 
 
 
271 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.31 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.79 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.16 
 
 
258 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  43.91 
 
 
284 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.92 
 
 
258 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.36 
 
 
252 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.5 
 
 
258 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  49.36 
 
 
252 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.36 
 
 
252 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  49.36 
 
 
252 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.36 
 
 
252 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.36 
 
 
252 aa  218  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.93 
 
 
273 aa  218  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.21 
 
 
254 aa  218  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.39 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.33 
 
 
258 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.07 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.64 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50 
 
 
260 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.2 
 
 
256 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.2 
 
 
256 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.2 
 
 
256 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.2 
 
 
256 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 
611 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.03 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.8 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.8 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.52 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.99 
 
 
256 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  45.91 
 
 
294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.99 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  48.11 
 
 
291 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.28 
 
 
262 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.16 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
609 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  41.1 
 
 
593 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4554  ABC transporter related  39.64 
 
 
670 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.32 
 
 
336 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.918096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  37.55 
 
 
568 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.88 
 
 
625 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1341  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  38.37 
 
 
349 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
547 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  40.83 
 
 
629 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
559 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
329 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2420  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.41 
 
 
369 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  37.4 
 
 
583 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  39.5 
 
 
573 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  42.04 
 
 
555 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  40.08 
 
 
578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  38.98 
 
 
570 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
625 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7775  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 
419 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.94 
 
 
626 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>