More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1558 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  100 
 
 
270 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  96.67 
 
 
270 aa  518  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  75.76 
 
 
266 aa  400  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  72.45 
 
 
266 aa  388  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  67.3 
 
 
263 aa  349  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000432714  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  64.77 
 
 
264 aa  348  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  62.12 
 
 
264 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  61.6 
 
 
266 aa  338  7e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  62.84 
 
 
265 aa  333  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  66.53 
 
 
266 aa  332  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  62.74 
 
 
264 aa  332  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  64.64 
 
 
265 aa  331  8e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  61.74 
 
 
264 aa  330  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  66.29 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  62.79 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  63.64 
 
 
266 aa  324  9e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  58.56 
 
 
265 aa  324  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  62.21 
 
 
265 aa  318  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  59.18 
 
 
267 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  58.11 
 
 
265 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  58.11 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  58.11 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  58.11 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  58.11 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  58.11 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  58.11 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  58.11 
 
 
265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  58.11 
 
 
265 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  58.11 
 
 
265 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  59.18 
 
 
267 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  57.69 
 
 
266 aa  308  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  57.74 
 
 
265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  57.92 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  60.74 
 
 
263 aa  299  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  55.34 
 
 
265 aa  298  6e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  55.34 
 
 
265 aa  298  6e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  55.82 
 
 
273 aa  297  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1461  septum site-determining protein MinD  59.02 
 
 
266 aa  295  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1552  septum site-determining protein MinD  56.82 
 
 
267 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0932  septum site-determining protein MinD  56.98 
 
 
267 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.602666 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0376  septum site-determining protein MinD  57.79 
 
 
266 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3383  septum site-determining protein MinD  61.9 
 
 
268 aa  285  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  60.62 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2768  septum site-determining protein MinD  58.78 
 
 
265 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3349  septum site-determining protein MinD  58.78 
 
 
265 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  51.92 
 
 
264 aa  278  5e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  52.99 
 
 
269 aa  277  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1993  septum site-determining protein MinD  60.23 
 
 
268 aa  274  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  51.31 
 
 
267 aa  270  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  62.55 
 
 
268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  53.25 
 
 
271 aa  268  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  53.25 
 
 
274 aa  268  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3019  septum site-determining protein MinD  59.43 
 
 
266 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1399  septum site-determining protein MinD  56.76 
 
 
264 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000334804  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1259  septum site-determining protein MinD  60.49 
 
 
266 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130783  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  50.19 
 
 
271 aa  255  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  49.44 
 
 
271 aa  254  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0856  septum site-determining protein MinD  48.15 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.866875  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  45.69 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0844  septum site-determining protein MinD  48.15 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0944  septum site-determining protein MinD  48.15 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0984  septum site-determining protein MinD  48.15 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2415  septum site-determining protein MinD  48.15 
 
 
271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0505  septum site-determining protein MinD  47.78 
 
 
271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.978735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  46.84 
 
 
269 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000643693  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  46.84 
 
 
269 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000178028  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4088  septum site-determining protein MinD  47.41 
 
 
271 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210489  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  250  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  49.8 
 
 
271 aa  250  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000037885  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2112  septum site-determining protein MinD  47.41 
 
 
271 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1980  septum site-determining protein MinD  47.41 
 
 
271 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3032  septum site-determining protein MinD  47.41 
 
 
271 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3066  septum site-determining protein MinD  47.41 
 
 
271 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1894  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000304586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1881  cell division inhibitor MinD  45.52 
 
 
271 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184306  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2632  septum site-determining protein MinD  47.41 
 
 
271 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22020  cell division inhibitor MinD  45.52 
 
 
271 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0588924  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000001062  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0800  septum site-determining protein MinD  47.41 
 
 
271 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2967  septum site-determining protein MinD  47.41 
 
 
271 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0502  septum site-determining protein MinD  48.12 
 
 
271 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0531405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1764  septum site-determining protein MinD  46.1 
 
 
269 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2757  cell division inhibitor MinD  47.41 
 
 
270 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000621875  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  47.04 
 
 
270 aa  248  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  45.72 
 
 
269 aa  248  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1689  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  46.27 
 
 
276 aa  248  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1688  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  46.27 
 
 
276 aa  248  7e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0276  septum site-determining protein MinD  44.44 
 
 
271 aa  248  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4341  septum site-determining protein MinD  50.19 
 
 
271 aa  248  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.243396 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1590  septum site-determining protein MinD  47.01 
 
 
269 aa  248  7e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.17933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3026  septum site-determining protein MinD  45.9 
 
 
272 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  45.72 
 
 
269 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  47.41 
 
 
270 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  47.41 
 
 
270 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  47.41 
 
 
270 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  48.16 
 
 
273 aa  247  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>