More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1520 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  44.81 
 
 
1011 aa  773    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  100 
 
 
1065 aa  2133    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  83.66 
 
 
914 aa  1458    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  31.16 
 
 
748 aa  293  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  26.54 
 
 
1157 aa  196  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  33.33 
 
 
641 aa  194  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  33.82 
 
 
657 aa  180  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  31.79 
 
 
766 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  28.44 
 
 
1224 aa  144  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  31.85 
 
 
640 aa  128  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  30.79 
 
 
624 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  30.29 
 
 
802 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  55.28 
 
 
863 aa  125  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  27.95 
 
 
979 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  43.7 
 
 
429 aa  115  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  54.05 
 
 
946 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  27.01 
 
 
488 aa  102  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  32.74 
 
 
630 aa  97.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  23.67 
 
 
522 aa  90.9  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  26.23 
 
 
431 aa  90.1  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  23.41 
 
 
522 aa  89.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  25.1 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  32.86 
 
 
623 aa  77.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  25.57 
 
 
310 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  45.24 
 
 
162 aa  75.1  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2808  alpha-clostripain-like protein  24.63 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  27.33 
 
 
904 aa  74.7  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  46.39 
 
 
164 aa  73.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  43.9 
 
 
252 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0849  FHA domain-containing protein  41.35 
 
 
150 aa  72  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  40.91 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  44.57 
 
 
152 aa  70.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0895  FHA domain containing protein  39.62 
 
 
122 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  37.63 
 
 
153 aa  69.7  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  33.33 
 
 
224 aa  69.7  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0899  FHA domain containing protein  38.68 
 
 
122 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  44.19 
 
 
150 aa  69.7  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5356  FHA domain containing protein  44.57 
 
 
150 aa  69.7  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  44.19 
 
 
150 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  43.02 
 
 
238 aa  69.3  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3741  FHA domain-containing protein  44.35 
 
 
245 aa  68.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.142285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.38 
 
 
878 aa  68.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3882  FHA domain containing protein  41.88 
 
 
258 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0596365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  45.16 
 
 
167 aa  67.4  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  35.77 
 
 
219 aa  67.4  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.98 
 
 
851 aa  67.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3859  FHA domain-containing protein  40.2 
 
 
195 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6874  FHA domain containing protein  34.72 
 
 
512 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3848  FHA domain containing protein  40 
 
 
149 aa  67.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  41.46 
 
 
155 aa  66.6  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2377  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
395 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.73 
 
 
606 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2102  FHA domain containing protein  40.21 
 
 
174 aa  67  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3629  Forkhead-associated protein  37.61 
 
 
222 aa  66.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  39.53 
 
 
1108 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  31.09 
 
 
566 aa  66.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  40.86 
 
 
245 aa  65.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  40.43 
 
 
268 aa  65.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3798  FHA domain containing protein  42.11 
 
 
255 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0693714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  37.78 
 
 
170 aa  65.5  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1456  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  53.97 
 
 
623 aa  65.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.80149  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0909  FHA domain-containing protein  38.64 
 
 
120 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  35.17 
 
 
225 aa  65.1  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0191  FHA domain-containing protein  32.64 
 
 
228 aa  64.7  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  38.71 
 
 
630 aa  65.1  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  42.39 
 
 
158 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  42.39 
 
 
158 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  42.39 
 
 
158 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  43.48 
 
 
178 aa  64.3  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 
138 aa  64.3  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11857  hypothetical protein  42.39 
 
 
162 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  40.24 
 
 
253 aa  63.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6476  FHA domain-containing protein  36.17 
 
 
158 aa  63.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  39.08 
 
 
152 aa  63.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5478  FHA domain containing protein  31.96 
 
 
673 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366631  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5913  diguanylate cyclase  42.53 
 
 
364 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  42.39 
 
 
157 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  39.78 
 
 
388 aa  63.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27040  FHA domain-containing protein  43.06 
 
 
137 aa  62.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  41.3 
 
 
170 aa  62.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  39.13 
 
 
147 aa  62.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  41.3 
 
 
177 aa  62.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  45.05 
 
 
312 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  34.65 
 
 
211 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  36.26 
 
 
513 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  42.39 
 
 
183 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  40.74 
 
 
262 aa  63.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  34.65 
 
 
211 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  41.33 
 
 
220 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 
385 aa  62.4  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
848 aa  62.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.86 
 
 
1004 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  45.57 
 
 
242 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1541  FHA domain-containing protein  40.22 
 
 
158 aa  62.4  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.439137  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.16 
 
 
510 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3742  FHA domain-containing protein  39.13 
 
 
144 aa  62.4  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4620  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 
479 aa  62  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3614  Forkhead-associated protein  37.63 
 
 
835 aa  62  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158405  hitchhiker  0.00251691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  46.05 
 
 
863 aa  62.4  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3610  FHA domain-containing protein  37.97 
 
 
1083 aa  62  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>