More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1509 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 326 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  92.64 
 
 		 329 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  74.46 
 
 		 328 aa  503  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  65.03 
 
 		 327 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  65.34 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  57.98 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  55.49 
 
 		 331 aa  358  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  54.41 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  54.8 
 
 		 328 aa  355  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 		 327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  53.19 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 		 328 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  53.35 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  53.19 
 
 		 329 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  52.58 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  51.53 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 330 aa  340  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  51.67 
 
 		 330 aa  338  9e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  52.58 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  52.19 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  51.53 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  52.78 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  49.09 
 
 		 331 aa  325  6e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  49.09 
 
 		 334 aa  318  7e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  48.94 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 		 330 aa  315  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  48.17 
 
 		 332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  46.2 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  46.2 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  49.7 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 318 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  48.58 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 		 323 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 321 aa  298  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.31 
 
 		 334 aa  297  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 323 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 332 aa  295  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  45.65 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  46.77 
 
 		 329 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  46.91 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 327 aa  285  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  47.81 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  48.32 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  45.9 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  44.62 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  41.46 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.14 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  45.37 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  43.65 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  45.48 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  41.46 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  43.54 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  45.96 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  44.72 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  44.14 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>