228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1500 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 590 aa  1154    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  59.87 
 
 		 613 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  27.4 
 
 		 578 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  26.87 
 
 		 564 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  26.68 
 
 		 565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  23.62 
 
 		 547 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  27.24 
 
 		 663 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  23.27 
 
 		 544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 571 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  22.48 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  22.32 
 
 		 549 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  22.83 
 
 		 544 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  21.96 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  22.83 
 
 		 544 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  22.58 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  21.83 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  27.49 
 
 		 560 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  26.49 
 
 		 546 aa  114  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  20.84 
 
 		 927 aa  107  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  27.35 
 
 		 528 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  29.77 
 
 		 577 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  28.43 
 
 		 551 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  28.81 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 172 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  41.41 
 
 		 141 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  41.41 
 
 		 141 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 160 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  25.09 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 124 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  35.64 
 
 		 146 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  42.37 
 
 		 173 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 126 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 126 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 126 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.4 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 129 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 129 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  23.83 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  40.5 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 122 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 121 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 121 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 		 131 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  31.96 
 
 		 124 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  34.65 
 
 		 124 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  36.11 
 
 		 133 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  37.11 
 
 		 144 aa  72  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  39.58 
 
 		 111 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  34.17 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  37.76 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  39.78 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  38.39 
 
 		 125 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 174 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  39.78 
 
 		 121 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 174 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 174 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  36.07 
 
 		 122 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  35.85 
 
 		 126 aa  68.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  32.67 
 
 		 124 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  32.67 
 
 		 124 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  32.67 
 
 		 124 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 124 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  32.67 
 
 		 124 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  32.67 
 
 		 124 aa  68.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  32.67 
 
 		 124 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.73 
 
 		 731 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.11 
 
 		 226 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 		 137 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  31.68 
 
 		 124 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  25.04 
 
 		 593 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  37.29 
 
 		 180 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 265 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 559 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  34.78 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  39.64 
 
 		 124 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  33.66 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  33.66 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 869 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  36.57 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 119 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  30 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  33.66 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  33.66 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  33.66 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 		 122 aa  63.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  34.01 
 
 		 170 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  32.09 
 
 		 184 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  34.39 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  30.6 
 
 		 223 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  37.29 
 
 		 692 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  36.71 
 
 		 130 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  32.03 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>