More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1495 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  90.95 
 
 		 199 aa  362  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  43.65 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.36 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  45.88 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  42.64 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  47.94 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.02 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  47.18 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  47.94 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  40.84 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.74 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  41.88 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  41.45 
 
 		 205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  46.43 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  44.67 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  45.5 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  44.56 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.79 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.32 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  38.74 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.67 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  39.79 
 
 		 329 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.3 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  40.39 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  42.86 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.1 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  40.98 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.68 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 349 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  36.65 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  40.31 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  35.79 
 
 		 241 aa  134  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 334 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  43.09 
 
 		 323 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.61 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  40.53 
 
 		 327 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  41.4 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  36.55 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.82 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.4 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  35.98 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 324 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 324 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 324 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  35.42 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  35.42 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  39.36 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  39.36 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  39.36 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  39.89 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  39.36 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  39.36 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  39.36 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 322 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  39.36 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.04 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 387 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  38.83 
 
 		 691 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.89 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  38.42 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 322 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 338 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  39.89 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.89 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  38.95 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.89 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  34.18 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 321 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.91 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.79 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 358 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 316 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  37.06 
 
 		 327 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  35.94 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  35.38 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 341 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  36.27 
 
 		 284 aa  117  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  40.21 
 
 		 374 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 369 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  40.21 
 
 		 369 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  36.96 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  35.75 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.38 
 
 		 338 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  37.57 
 
 		 319 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 357 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 327 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 321 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 242 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>