61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1450 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 115 aa  230  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  63.3 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  50.98 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  39.66 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  40.19 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  38.04 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  44.66 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  45.12 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  40.38 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  40.78 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  38.83 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  42.05 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  37.74 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  34.26 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  32.69 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  34.02 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  44.12 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  38.32 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  35.85 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  30.56 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  35.85 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  35.85 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  35.92 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  29.67 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  31.48 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  36.07 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  33.64 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  33.98 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 151 aa  42  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  28.46 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  28.71 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  36.62 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  33.75 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2162  DNA polymerase beta subunit  30.67 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  28.18 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  32.38 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 107 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>