223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1412 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  362  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  88.04 
 
 
184 aa  313  8e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  83.15 
 
 
184 aa  305  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  78.8 
 
 
184 aa  289  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  44.57 
 
 
213 aa  151  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  48 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  41.44 
 
 
187 aa  140  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  40.45 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  40.45 
 
 
191 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  39.33 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5097  protein of unknown function DUF820  34.22 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0734  protein of unknown function DUF820  33.14 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1790  hypothetical protein  32.61 
 
 
192 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2128  hypothetical protein  30.27 
 
 
192 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4017  protein of unknown function DUF820  33.89 
 
 
182 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.389998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1761  protein of unknown function DUF820  30.98 
 
 
194 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1268  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 
193 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4062  hypothetical protein  33.13 
 
 
178 aa  101  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.654583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1238  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 
193 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1209  protein of unknown function DUF820  28.65 
 
 
195 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2049  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2023  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1789  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 
194 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0815635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4387  hypothetical protein  29.51 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1919  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
195 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1895  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
195 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2366  protein of unknown function DUF820  28.02 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2794  protein of unknown function DUF820  29.19 
 
 
191 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274491  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3323  protein of unknown function DUF820  29.19 
 
 
191 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2428  protein of unknown function DUF820  32.89 
 
 
192 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2042  protein of unknown function DUF820  29.11 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000371183  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0074  protein of unknown function DUF820  27.32 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.716542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0076  protein of unknown function DUF820  27.32 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2017  protein of unknown function DUF820  29.11 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0713  protein of unknown function DUF820  30.57 
 
 
195 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.277122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2438  protein of unknown function DUF820  33.12 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.873691  normal  0.192917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2170  protein of unknown function DUF820  32.89 
 
 
192 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2387  protein of unknown function DUF820  33.12 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3010  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
191 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0100  hypothetical protein  29.28 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637727  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0572  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5150  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1440  protein of unknown function DUF820  23.81 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0267  protein of unknown function DUF820  27.85 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2465  protein of unknown function DUF820  28.18 
 
 
190 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4048  hypothetical protein  44.44 
 
 
123 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726239  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3416  protein of unknown function DUF820  29.38 
 
 
190 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2598  protein of unknown function DUF820  26.98 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.855565  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0267  protein of unknown function DUF820  27.85 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0999  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 
191 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5248  protein of unknown function DUF820  27.57 
 
 
194 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.73684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3326  hypothetical protein  26.37 
 
 
191 aa  84.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.138444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2463  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3644  protein of unknown function DUF820  27.62 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0643  hypothetical protein  30.46 
 
 
192 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263684  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0468  protein of unknown function DUF820  30.38 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0619139  normal  0.13059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1060  hypothetical protein  31.67 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000122836  decreased coverage  0.00000222645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1028  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0102  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0341  protein of unknown function DUF820  32.26 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000574884  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3284  protein of unknown function DUF820  25.65 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000638939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0963  protein of unknown function DUF820  29.38 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000104175  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2815  protein of unknown function DUF820  25.65 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1357  hypothetical protein  27.27 
 
 
204 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000002681  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1493  protein of unknown function DUF820  28.16 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000252154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4918  protein of unknown function DUF820  27.65 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2406  protein of unknown function DUF820  25.67 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1609  protein of unknown function DUF820  31.95 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0891  protein of unknown function DUF820  28.73 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1466  hypothetical protein  31.95 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0533838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2985  protein of unknown function DUF820  29.3 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2886  protein of unknown function DUF820  26.52 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0099  protein of unknown function DUF820  31.18 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3773  hypothetical protein  30.57 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211833  normal  0.137828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  26.79 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1596  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5396  protein of unknown function DUF820  36.45 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  28.99 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  27.59 
 
 
241 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2174  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0729554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2896  protein of unknown function DUF820  26.59 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  31.9 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3948  hypothetical protein  29.32 
 
 
204 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5071  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  24.71 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  36.55 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  30.05 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  29.6 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  31.41 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  26.19 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  28.4 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.79 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  28.66 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  34.66 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3972  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  30.36 
 
 
209 aa  61.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  27.41 
 
 
251 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3227  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  32.74 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>