More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1397 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 227 aa  193  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 240 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.75 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.93 
 
 		 230 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.68 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 225 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 232 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.38 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 226 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 228 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.74 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  42.26 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  38.96 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  41.45 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  38.96 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  41.45 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.96 
 
 		 223 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.96 
 
 		 223 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.53 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  38.96 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 231 aa  175  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 245 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  40.6 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  40.6 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  38.43 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  41.42 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.95 
 
 		 229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  39.59 
 
 		 239 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.52 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 223 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  40.09 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  37.87 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 225 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  39.66 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  40.82 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  39.08 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>