68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1372 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 402 aa  815    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  75.56 
 
 		 409 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  38.89 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.54 
 
 		 291 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 		 293 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  33.66 
 
 		 293 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  32.5 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  31.6 
 
 		 298 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  31.55 
 
 		 294 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  28.88 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  30.66 
 
 		 298 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  29.84 
 
 		 293 aa  99.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 289 aa  96.3  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 		 292 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 295 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 295 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  28.93 
 
 		 296 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  28.38 
 
 		 295 aa  92.8  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  33.69 
 
 		 292 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  31.05 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  31.35 
 
 		 292 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 291 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 		 292 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  27.07 
 
 		 293 aa  87  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  31.34 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  25.62 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  28 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  28.43 
 
 		 293 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 293 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  25.91 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  28.42 
 
 		 297 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  23.3 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.2 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  27.41 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  23.17 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  26 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  28.98 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0352  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.33 
 
 		 296 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  25.32 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0270  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 929 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.669686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  27.06 
 
 		 504 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 716 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>