More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1359 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 458 aa  940    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  93.1 
 
 		 454 aa  865    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  53.48 
 
 		 441 aa  488  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 		 483 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 442 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.66 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.29 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 427 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.07 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 420 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.95 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.41 
 
 		 443 aa  95.1  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  21.24 
 
 		 460 aa  93.2  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 		 447 aa  91.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  23.16 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.4 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 488 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2545  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  27.71 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  29.75 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.06 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  29.88 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.1 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  27.95 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  27.95 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.08 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.03 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  33.74 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  30.91 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  30.86 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 453 aa  67  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 925 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.89 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  26.95 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.12 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  21.16 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.66 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>