More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1251 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  78.26 
 
 
482 aa  723    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  100 
 
 
483 aa  947    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  48.5 
 
 
465 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  39.08 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  39.65 
 
 
457 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  38.55 
 
 
432 aa  256  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  40.05 
 
 
427 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  29.59 
 
 
427 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  28.05 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  30.18 
 
 
430 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  30.18 
 
 
430 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  29.92 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  29.73 
 
 
434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  29.26 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  30.73 
 
 
417 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  30.16 
 
 
423 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  27.73 
 
 
431 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  31.55 
 
 
421 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  30.03 
 
 
447 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  30.75 
 
 
412 aa  123  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  29.9 
 
 
416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  26.57 
 
 
491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  31.38 
 
 
409 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  30.37 
 
 
1082 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  28.03 
 
 
496 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  28.03 
 
 
496 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  32.14 
 
 
389 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 
413 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 
413 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  27.84 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  28.86 
 
 
400 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  28.35 
 
 
426 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  26.98 
 
 
434 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 
449 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  26.54 
 
 
458 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 
446 aa  113  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  26.54 
 
 
458 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.41 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  25.78 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  27.35 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  29.1 
 
 
1090 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  27.95 
 
 
429 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  26.5 
 
 
434 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  26.19 
 
 
434 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  29.73 
 
 
446 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  29.13 
 
 
402 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  29.62 
 
 
484 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 
394 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  30.67 
 
 
470 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  28.8 
 
 
402 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  29.65 
 
 
417 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  32.19 
 
 
437 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  31.4 
 
 
459 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  23.19 
 
 
428 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  29.48 
 
 
443 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  24.87 
 
 
410 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  29.12 
 
 
461 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  31.87 
 
 
437 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  29.28 
 
 
395 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  27.15 
 
 
429 aa  104  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  32.19 
 
 
437 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 
410 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  28.66 
 
 
554 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  26 
 
 
401 aa  103  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  29.94 
 
 
401 aa  103  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  30.13 
 
 
423 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3806  peptidase S41  31.15 
 
 
509 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  27.94 
 
 
472 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 
379 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  28.35 
 
 
683 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  26.17 
 
 
444 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  32.98 
 
 
401 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  27.98 
 
 
425 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  28.87 
 
 
401 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3939  carboxyl-terminal protease  28.96 
 
 
1073 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0122378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  27.48 
 
 
401 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3853  carboxyl-terminal protease  28.62 
 
 
1073 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  26.45 
 
 
356 aa  101  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  28.25 
 
 
457 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  26.45 
 
 
444 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  25.71 
 
 
435 aa  100  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  27.33 
 
 
434 aa  100  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3796  carboxyl-terminal protease  28.62 
 
 
1072 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  26.15 
 
 
444 aa  100  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  30.89 
 
 
455 aa  100  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  29.25 
 
 
401 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  29.4 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  26.09 
 
 
433 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  27.45 
 
 
428 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 
547 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  26.7 
 
 
444 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  30.55 
 
 
457 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 
418 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  30.31 
 
 
437 aa  99  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  29.55 
 
 
401 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  28.96 
 
 
401 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  26.7 
 
 
450 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0234  peptidase S41  30.9 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>