142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1248 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  94.22 
 
 		 318 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  95.86 
 
 		 166 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  89.41 
 
 		 154 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  42.32 
 
 		 315 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  45.28 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  39.81 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  39.81 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  36.73 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  34.35 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  31.06 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  32.31 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  35.69 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  33.92 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  34.27 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  34.78 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  33.57 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  35.98 
 
 		 280 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  33.58 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  33.71 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  34.75 
 
 		 290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  32.67 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  31.34 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  30.03 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  30.18 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  29.54 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  31.2 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  29.88 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  29.05 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  29.79 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  27.93 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  29.05 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  37.29 
 
 		 134 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  27.3 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  27.48 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4873  hypothetical protein  29.3 
 
 		 286 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  27.8 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  28.88 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  27.38 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  26.87 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  29.35 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  27.69 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  26.63 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  23.26 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  26.82 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  24.72 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  26.85 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3060  hypothetical protein  24.63 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  26.35 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  26.14 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  26.55 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  25.61 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  25.61 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  26 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  26.37 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0684  hypothetical protein  29.91 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.92177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4879  hypothetical protein  44.16 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  24.25 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  24.66 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  25.49 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0951658  normal  0.295077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2074  hypothetical protein  24.2 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2072  hypothetical protein  23.36 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.166176 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  22.29 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  27.84 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  27.84 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2285  hypothetical protein  24.5 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  23.65 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.54 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  35.56 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  23.68 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2442  hypothetical protein  25.81 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  hitchhiker  0.000000122281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  36.96 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  35.87 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  25.88 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1818  hypothetical protein  26.36 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.937622 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  26.49 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  25.53 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  42.71 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3228  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000432911  normal  0.0886646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  24.13 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1724  hypothetical protein  26.24 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  24.13 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  24.52 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  24.44 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  36.17 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1128  hypothetical protein  19.71 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  23.85 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  39.13 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  25.36 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0681  hypothetical protein  27.1 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0749  hypothetical protein  27.82 
 
 		 122 aa  53.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000564338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1071  hypothetical protein  50.88 
 
 		 294 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  24.4 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1422  hypothetical protein  35.56 
 
 		 161 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1243  hypothetical protein  37.84 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>