More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1228 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  80.24 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  55.9 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.31 
 
 		 143 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  54.76 
 
 		 139 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.39 
 
 		 138 aa  121  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  44.36 
 
 		 150 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.41 
 
 		 140 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  45.9 
 
 		 143 aa  108  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  46.62 
 
 		 142 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  42.75 
 
 		 164 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.44 
 
 		 152 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 143 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40 
 
 		 154 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  37.78 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  45.38 
 
 		 151 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  34.54 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.27 
 
 		 137 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  43.08 
 
 		 140 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.38 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 		 141 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 		 142 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.26 
 
 		 137 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 		 150 aa  99.4  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.31 
 
 		 144 aa  99  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.96 
 
 		 138 aa  98.6  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  41.94 
 
 		 132 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  33.6 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.71 
 
 		 157 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.89 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.88 
 
 		 139 aa  96.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.84 
 
 		 146 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  44.09 
 
 		 144 aa  96.3  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  43.8 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  35.27 
 
 		 218 aa  95.9  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 		 174 aa  95.5  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.65 
 
 		 137 aa  95.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 		 144 aa  95.5  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.65 
 
 		 137 aa  95.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 		 138 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 143 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 140 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 		 144 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 		 144 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  45.6 
 
 		 145 aa  92.8  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.96 
 
 		 139 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.33 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 		 144 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.55 
 
 		 150 aa  92  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  41.35 
 
 		 148 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 143 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 		 151 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  46.77 
 
 		 132 aa  91.3  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 		 168 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 		 141 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  34.05 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  36.64 
 
 		 145 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 145 aa  90.1  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  39.71 
 
 		 148 aa  89.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  38.89 
 
 		 139 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 		 138 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 149 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 		 139 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 		 148 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.26 
 
 		 150 aa  89.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 		 166 aa  88.6  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.65 
 
 		 136 aa  88.6  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 177 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 		 142 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  41.43 
 
 		 167 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.43 
 
 		 167 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  38.64 
 
 		 145 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  45.83 
 
 		 165 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  36.43 
 
 		 144 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.62 
 
 		 142 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  37.31 
 
 		 167 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.29 
 
 		 165 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  37.4 
 
 		 140 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 		 165 aa  86.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.97 
 
 		 139 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 175 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 		 142 aa  85.5  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  42.97 
 
 		 142 aa  85.5  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 		 167 aa  85.5  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>