25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1215 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  100 
 
 		 228 aa  441  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  86.6 
 
 		 231 aa  342  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  61.35 
 
 		 208 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  59.73 
 
 		 222 aa  237  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  48.31 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  48.42 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  48.42 
 
 		 217 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  44.93 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  42.02 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  36.71 
 
 		 208 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  31.05 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  34.4 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  30.53 
 
 		 204 aa  105  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  30.59 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.13 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  24.6 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.92 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0034  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.54 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  25.81 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0790  haloacid dehalogenase superfamily protein  23.63 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.33 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0637  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.21 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.27 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.83 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.36 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>