31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1210 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1210  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1112    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4191  hypothetical protein  99.82 
 
 
548 aa  1108    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2480  hypothetical protein  31.21 
 
 
559 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465258  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2755  hypothetical protein  31.21 
 
 
559 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2757  hypothetical protein  31.21 
 
 
559 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4522  hypothetical protein  31.21 
 
 
559 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0004  hypothetical protein  40.83 
 
 
282 aa  185  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000224703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6181  hypothetical protein  32.75 
 
 
468 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173212  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5012  hypothetical protein  30.63 
 
 
414 aa  127  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0495  Y4jO-like protein  29.94 
 
 
319 aa  123  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2913  hypothetical protein  36.87 
 
 
258 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5046  hypothetical protein  30 
 
 
337 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3697  hypothetical protein  44.71 
 
 
97 aa  84.7  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321698  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3171  hypothetical protein  37.31 
 
 
155 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4512  hypothetical protein  35.82 
 
 
155 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0599406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0942  hypothetical protein  34.09 
 
 
209 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.736579  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2159  hypothetical protein  36.62 
 
 
76 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5578  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1179  hypothetical protein  41.51 
 
 
72 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  23.64 
 
 
478 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  24.71 
 
 
482 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  32.71 
 
 
506 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  22.99 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  23.66 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  23.66 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  23.66 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  23.85 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  23.85 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  24.11 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  23.66 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  31.78 
 
 
506 aa  43.5  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>