More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1168 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  95.56 
 
 		 180 aa  339  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  81.03 
 
 		 179 aa  278  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  67.46 
 
 		 182 aa  218  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  67.48 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  65.84 
 
 		 173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  67.28 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  65.22 
 
 		 169 aa  205  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  65.84 
 
 		 169 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  65.22 
 
 		 169 aa  205  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  63.98 
 
 		 166 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  200  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 164 aa  200  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  63.8 
 
 		 166 aa  200  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  65.22 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  63.8 
 
 		 166 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  61.96 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  61.73 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  63.41 
 
 		 167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  61.45 
 
 		 168 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  64.6 
 
 		 163 aa  193  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  62.89 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  62.89 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  57.83 
 
 		 168 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  60.87 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 		 162 aa  184  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 162 aa  184  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  61.88 
 
 		 162 aa  184  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 162 aa  184  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 165 aa  183  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 165 aa  183  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 169 aa  180  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  67.35 
 
 		 200 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  61.35 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  58.38 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  57.14 
 
 		 173 aa  177  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  60.84 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  65.31 
 
 		 225 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  63.52 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  60.9 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  60.98 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  65.31 
 
 		 202 aa  174  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  65.31 
 
 		 202 aa  174  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  57.89 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 172 aa  174  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  55.62 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  52.76 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  62.89 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  52.44 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  60.24 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  52.07 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  60.87 
 
 		 147 aa  171  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 		 163 aa  171  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0468  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 163 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  63.27 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  65.31 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0491  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0937948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 147 aa  170  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 171 aa  170  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_433  ribosomal protein S5  53.37 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  56.49 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 236 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  60 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 172 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5062  30S ribosomal protein S5  54.61 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956097  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  57.69 
 
 		 174 aa  168  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  54.71 
 
 		 172 aa  167  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  52.76 
 
 		 170 aa  167  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>