More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1165 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 450 aa  885    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  95.78 
 
 		 450 aa  858    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3004  preprotein translocase, SecY subunit  70.04 
 
 		 450 aa  588  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339766  normal  0.010011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  60.84 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  54.85 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  49.45 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  48.79 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  49.45 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  45.33 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  46.52 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  44.1 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  45.11 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  47.45 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.58 
 
 		 435 aa  360  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  43.47 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  44.81 
 
 		 421 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  44.22 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  41.11 
 
 		 437 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  41.78 
 
 		 435 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.46 
 
 		 435 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 		 435 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.22 
 
 		 419 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  42.16 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  41.37 
 
 		 437 aa  350  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  43.64 
 
 		 428 aa  349  7e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.52 
 
 		 442 aa  348  9e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.44 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  41.24 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  43.68 
 
 		 438 aa  346  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 445 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 		 437 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  39.29 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  39.82 
 
 		 443 aa  342  7e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  44.79 
 
 		 431 aa  342  8e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  42.61 
 
 		 431 aa  341  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  42.01 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  42.95 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.51 
 
 		 447 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  41.78 
 
 		 448 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.8 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  41.76 
 
 		 445 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  41.39 
 
 		 432 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  43.18 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  38.9 
 
 		 443 aa  335  9e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  40.27 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  43.79 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  40.9 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  42.66 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  44.86 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.65 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  41.33 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  41.82 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  41.4 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  41.61 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  38.33 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  41.22 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  38.19 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  40.22 
 
 		 448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  41.22 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  41.81 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  41.22 
 
 		 446 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  40.88 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  40.36 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  40.36 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  40.99 
 
 		 446 aa  326  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  39.47 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  42.13 
 
 		 448 aa  325  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  40.68 
 
 		 442 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  40.82 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  39.41 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  43.07 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  42.08 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  41.58 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  38.77 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.08 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  40.81 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  42.52 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  41.61 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  41.54 
 
 		 445 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  40.74 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  41.09 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  40.99 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  39.41 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  40.36 
 
 		 448 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  40.86 
 
 		 444 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  40.86 
 
 		 444 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  40.67 
 
 		 443 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 444 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>