243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1162 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4003  50S ribosomal protein L36  97.37 
 
 		 38 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000226529  hitchhiker  0.0000138674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  92.11 
 
 		 38 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 41 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  73.68 
 
 		 39 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0349  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1946  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 46 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.779159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3724  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 46 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0547196  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3500  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 46 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000298686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2610  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3469  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  0.000000000119611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3275  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000772406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0289  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0370  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2928  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000225133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  76.32 
 
 		 37 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0498  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000794474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 39 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3158  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3295  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0475  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100421  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  59.46 
 
 		 38 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1369  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  63.16 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  55.26 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0510  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  51.6  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  51.6  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000518993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0622  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0139923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0267  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0649  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141795  hitchhiker  0.00000401292 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000250249  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2148  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0657747  normal  0.398863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0191  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 48 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000986324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2041  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  50.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658877  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2610  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142007  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3503  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000992018  hitchhiker  0.0000000744799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>