129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1145 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1145  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3986  hypothetical protein  94.98 
 
 
294 aa  517  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2337  protein of unknown function DUF147  73.33 
 
 
276 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3416  hypothetical protein  66.91 
 
 
267 aa  357  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1817  protein of unknown function DUF147  50 
 
 
266 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2672  protein of unknown function DUF147  49.41 
 
 
273 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0604  protein of unknown function DUF147  49.59 
 
 
275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000675285  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0292  hypothetical protein  46.92 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0832  protein of unknown function DUF147  46.3 
 
 
271 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000526426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2248  hypothetical protein  45.04 
 
 
277 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.356629  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0240  protein of unknown function DUF147  45.78 
 
 
272 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0934  hypothetical protein  43.95 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0156  hypothetical protein  45.1 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.374627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0150  hypothetical protein  45.1 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.888291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0148  hypothetical protein  45.1 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0155  hypothetical protein  45.1 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0199  conserved hypothetical protein TIGR00159  45.1 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0187  conserved hypothetical protein TIGR00159  45.14 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0290754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5137  hypothetical protein  45.14 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0178  conserved hypothetical protein TIGR00159  45.1 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0155  hypothetical protein  45.1 
 
 
273 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0149  hypothetical protein  44.75 
 
 
273 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0148  hypothetical protein  45.56 
 
 
276 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0370  protein of unknown function DUF147  45.45 
 
 
275 aa  193  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0156  protein of unknown function DUF147  47.52 
 
 
273 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000602517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2195  hypothetical protein  44.49 
 
 
269 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2233  hypothetical protein  44.49 
 
 
269 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.785168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1764  hypothetical protein  44.03 
 
 
269 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0152  protein of unknown function DUF147  46.34 
 
 
273 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  43.36 
 
 
273 aa  186  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  42.34 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1201  protein of unknown function DUF147  39.5 
 
 
309 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0477  hypothetical protein  39.13 
 
 
292 aa  182  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0407  hypothetical protein  41.3 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000461408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1515  hypothetical protein  45.64 
 
 
249 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1288  hypothetical protein  41.73 
 
 
282 aa  180  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000108276  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1932  hypothetical protein  44.35 
 
 
266 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0837  protein of unknown function DUF147  44.53 
 
 
275 aa  179  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2103  hypothetical protein  47.62 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1166  hypothetical protein  42.06 
 
 
292 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000552202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0057  protein of unknown function DUF147  41.73 
 
 
247 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3551  hypothetical protein  38.52 
 
 
293 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000686428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0999  hypothetical protein  40.32 
 
 
261 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000188135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0278  hypothetical protein  46.12 
 
 
292 aa  168  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911032  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1656  hypothetical protein  43.3 
 
 
297 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1785  hypothetical protein  43.43 
 
 
248 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0006  protein of unknown function DUF147  41.56 
 
 
248 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163488  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0885  hypothetical protein  39.22 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0135  hypothetical protein  42.23 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.575815  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2336  hypothetical protein  42.21 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1725  protein of unknown function DUF147  41.04 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175281  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0255  protein of unknown function DUF147  39.43 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000845039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0146  protein of unknown function DUF147  41.42 
 
 
269 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0110  protein of unknown function DUF147  43.09 
 
 
275 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0161  protein of unknown function DUF147  43.23 
 
 
239 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1909  hypothetical protein  36.23 
 
 
274 aa  155  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2660  hypothetical protein  42.21 
 
 
285 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2346  hypothetical protein  42.21 
 
 
285 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2186  protein of unknown function DUF147  39.27 
 
 
260 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0400  protein of unknown function DUF147  35.74 
 
 
291 aa  149  5e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1807  hypothetical protein  38.46 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.895114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  35.29 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1497  hypothetical protein  42.21 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1232  hypothetical protein  40.65 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3222  hypothetical protein  36.18 
 
 
282 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0008  hypothetical protein  34.13 
 
 
256 aa  145  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.487751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0263  hypothetical protein  41.43 
 
 
306 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1715  protein of unknown function DUF147  37.14 
 
 
279 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1888  hypothetical protein  34.56 
 
 
255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000352181  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2433  hypothetical protein  39.15 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0471214  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09941  hypothetical protein  40 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.828621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2732  hypothetical protein  37.4 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76859  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1392  hypothetical protein  39.92 
 
 
276 aa  139  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2458  protein of unknown function DUF147  41.8 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2370  protein of unknown function DUF147  41.8 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1630  hypothetical protein  39.3 
 
 
276 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0696242  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0843  protein of unknown function DUF147  39.67 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4701  protein of unknown function DUF147  39.02 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  35.14 
 
 
470 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3055  protein of unknown function DUF147  35.2 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0416862  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11821  hypothetical protein  36.9 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10951  hypothetical protein  38.15 
 
 
303 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0677195  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13513  putative transmembrane protein  36.6 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4735  hypothetical protein  37.35 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3550  protein of unknown function DUF147  35.6 
 
 
480 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000131066  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0895  protein of unknown function DUF147  36.25 
 
 
388 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  34.6 
 
 
471 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3664  protein of unknown function DUF147  35.62 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14891  hypothetical protein  37.97 
 
 
300 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0657  hypothetical protein  37.55 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2673  protein of unknown function DUF147  34.52 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0979308 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1102  hypothetical protein  35.27 
 
 
301 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11981  hypothetical protein  35.27 
 
 
302 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241357  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11971  hypothetical protein  36.05 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0124  protein of unknown function DUF147  39.38 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0678781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0127  protein of unknown function DUF147  39.38 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3366  protein of unknown function DUF147  36.25 
 
 
388 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0913  hypothetical protein  37.35 
 
 
321 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  34.94 
 
 
470 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1168  hypothetical protein  35.52 
 
 
471 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000542282  normal  0.0311733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>