90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1132 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  283  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  90.4 
 
 		 125 aa  226  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  48.91 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  38.1 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  38.89 
 
 		 147 aa  84.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  37.07 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  37.93 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  36.51 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  39.81 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  39.05 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  34.92 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  34.13 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  39.37 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  37.82 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  37.6 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  37.6 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  37.6 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  39.05 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  35.2 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  35.2 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  35.2 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  36 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  38.98 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  37.14 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  34.17 
 
 		 284 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  34.71 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  36.67 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  33.88 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  35.54 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  35.54 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  40.2 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  40.2 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  36.73 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  38.24 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  35.48 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  34.71 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  35.4 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  32.38 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  29.82 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  31.93 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  40.17 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  31.78 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  32.69 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  34.23 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  31.78 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  34.15 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  28.97 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  37.19 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  32 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  30.08 
 
 		 267 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  31.43 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2542  hypothetical protein  42.11 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373163  normal  0.593435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2530  inner membrane protein YfbW  42.11 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2487  inner membrane protein YfbW  42.11 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2438  inner membrane protein YfbW  42.11 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  37.31 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2646  inner membrane protein YfbW  45.45 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  41.38 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  30.19 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0131  hypothetical protein  30.95 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0651  transporter protein  37.35 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.282773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  27.97 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  28.8 
 
 		 121 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  44 
 
 		 135 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  29.25 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  36.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  36.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  36.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  36.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  36.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  36.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  36.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2031  hypothetical protein  31.88 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.379833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>